More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0230 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0308  30S ribosomal protein S12  81.6 
 
 		 127 aa  200  7e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000773303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 123 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  78.4 
 
 		 125 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  74.4 
 
 		 135 aa  194  2.0000000000000003e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  77.78 
 
 		 126 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  80 
 
 		 127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  193  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 126 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 125 aa  193  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  193  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  77.87 
 
 		 134 aa  193  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 126 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  76.42 
 
 		 123 aa  191  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  76 
 
 		 125 aa  191  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 126 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 128 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  79.37 
 
 		 127 aa  192  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  79.03 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000759048  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 		 125 aa  191  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  76.8 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  76.8 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  76.8 
 
 		 125 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 127 aa  190  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  76 
 
 		 125 aa  190  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  77.6 
 
 		 125 aa  190  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2823  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  190  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0494947 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  76.8 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 		 126 aa  189  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  76.61 
 
 		 125 aa  189  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  189  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 135 aa  188  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 124 aa  188  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  75.4 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 125 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  75.41 
 
 		 123 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 133 aa  188  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  77.24 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 154 aa  187  4e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 125 aa  187  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  73.81 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0355  30S ribosomal protein S12  76.19 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  73.81 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  73.6 
 
 		 126 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 124 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  186  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  75.2 
 
 		 125 aa  186  8e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 137 aa  186  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  75.81 
 
 		 124 aa  186  9e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  72.58 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  74.4 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  76.03 
 
 		 137 aa  185  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  75.61 
 
 		 124 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  72.58 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_002620  TC0723  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0867606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 123 aa  184  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  184  5e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  71.77 
 
 		 124 aa  184  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0837  ribosomal protein S12  78.05 
 
 		 124 aa  184  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.443392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  184  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  73.98 
 
 		 123 aa  184  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  183  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  71.2 
 
 		 128 aa  183  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  70.63 
 
 		 127 aa  183  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>