More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2104 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2104  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 154 aa  315  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2194  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  253  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.248846  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04528  30S ribosomal protein S12  97.58 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000336955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0751  30S ribosomal protein S12  96.77 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.938944  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 124 aa  215  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 124 aa  214  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  0.000000000093676 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  214  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 125 aa  213  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 124 aa  213  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  213  9e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 125 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 125 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 125 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0290  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 124 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000638987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 125 aa  212  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000877595  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 125 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 125 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 125 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1859  30S ribosomal protein S12  73.76 
 
 		 140 aa  211  3.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000297311  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  82.26 
 
 		 124 aa  210  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0863  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  210  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 125 aa  210  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  210  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 125 aa  209  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  209  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  0.00000480785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 124 aa  209  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  209  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  209  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  209  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0416  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00364585  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 126 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 124 aa  208  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0449  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245069  unclonable  0.000000302311 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0482  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00887343  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  83.06 
 
 		 126 aa  207  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0600  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  208  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00583114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4754  30S ribosomal protein S12  82.93 
 
 		 123 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0069971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  81.45 
 
 		 125 aa  207  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0310  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  207  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00417807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0208  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  207  5e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000137299  unclonable  0.00000763444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  206  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0479  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  206  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.135027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3440  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  206  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000139403  hitchhiker  0.000104981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1647  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 124 aa  206  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000349263  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  205  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5084  30S ribosomal protein S12  82.11 
 
 		 123 aa  205  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000372419  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2771  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0332  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  204  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  2.75443e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  79.84 
 
 		 125 aa  204  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0453  30S ribosomal protein S12  82.26 
 
 		 124 aa  205  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  80.49 
 
 		 125 aa  204  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4551  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187962  normal  0.158783 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 127 aa  204  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3830  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 128 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0316  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000103775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0621  ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4553  30S ribosomal protein S12  81.3 
 
 		 123 aa  204  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  78.86 
 
 		 128 aa  204  4e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00698  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000175527  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3921  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 128 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4010  30S ribosomal protein S12  78.23 
 
 		 124 aa  204  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000175361  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  80.65 
 
 		 128 aa  204  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>