More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0314 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0314  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 125 aa  253  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.4670400000000002e-24  hitchhiker  0.000521064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3024  30S ribosomal protein S12  92.8 
 
 		 125 aa  237  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000203236  decreased coverage  0.00243586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2955  30S ribosomal protein S12  92.8 
 
 		 125 aa  237  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0353473  hitchhiker  0.000186229 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3302  30S ribosomal protein S12  92.8 
 
 		 125 aa  237  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.000000119116  hitchhiker  0.00857233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  93.6 
 
 		 125 aa  235  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  92 
 
 		 125 aa  234  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  91.2 
 
 		 125 aa  233  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  91.2 
 
 		 125 aa  231  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0400  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 125 aa  229  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000378884  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  89.6 
 
 		 126 aa  229  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  228  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  88.8 
 
 		 126 aa  226  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4010  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  225  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000175361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1647  30S ribosomal protein S12  88.71 
 
 		 124 aa  226  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000349263  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3830  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  225  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4551  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187962  normal  0.158783 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3921  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3678  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0316  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  224  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000103775  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0398  ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000213628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 125 aa  224  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0275  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 124 aa  225  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000516158  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03193  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000163524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0371  ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.72822e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4651  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000289179  normal  0.0331168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3811  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000707874  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3816  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000929578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3716  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000501374  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0198  30S ribosomal protein S12  87.9 
 
 		 125 aa  224  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000216597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0371  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000085622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3623  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000437781  hitchhiker  0.00102152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3753  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00207543  normal  0.0353577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3644  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000993601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03144  hypothetical protein  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000164791  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3759  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000474528  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3645  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3538  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.3416399999999996e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3718  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 124 aa  224  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000740519  normal  0.0746879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0251  30S ribosomal protein S12  87.2 
 
 		 125 aa  224  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 125 aa  224  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  87.1 
 
 		 125 aa  224  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  88 
 
 		 125 aa  223  8e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  86.4 
 
 		 125 aa  222  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  86.4 
 
 		 125 aa  222  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  88 
 
 		 126 aa  221  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0832  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0714  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 124 aa  221  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08790  30S ribosomal protein S12  88.62 
 
 		 123 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.762272  normal  0.0106283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002297  SSU ribosomal protein S12p (S23e)  86.29 
 
 		 124 aa  220  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000970736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00057  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 124 aa  220  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 126 aa  220  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 126 aa  220  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 125 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  85.6 
 
 		 126 aa  220  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  85.48 
 
 		 125 aa  219  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2329  30S ribosomal protein S12  85.6 
 
 		 125 aa  219  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000813391  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4281  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 124 aa  219  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000473434  unclonable  0.00000000000278938 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0926  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  219  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000117239  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1259  30S ribosomal protein S12  86.29 
 
 		 125 aa  219  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  86.4 
 
 		 125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2771  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 124 aa  218  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000785263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06190  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  218  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0310  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 124 aa  217  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00417807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2329  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 124 aa  217  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000396371  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2435  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.141919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4767  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 124 aa  217  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2118  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2157  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.949049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1358  30S ribosomal protein S12  87.8 
 
 		 123 aa  216  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.179796  normal  0.150246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0416  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 124 aa  216  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00364585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2377  30S ribosomal protein S12  84.68 
 
 		 124 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00376879  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3914  30S ribosomal protein S12  86.18 
 
 		 123 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1244  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  215  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1903  30S ribosomal protein S12  84.55 
 
 		 123 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2290  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0600  30S ribosomal protein S12  83.87 
 
 		 124 aa  215  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00583114  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3453  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3189  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3672  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  86.99 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1359  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.604164 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1540  30S ribosomal protein S12  83.74 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.966808  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4754  30S ribosomal protein S12  85.37 
 
 		 123 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0069971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>