More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50701 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  100 
 
 		 143 aa  291  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  79.72 
 
 		 142 aa  222  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  75.35 
 
 		 145 aa  219  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  72.54 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  72.34 
 
 		 145 aa  204  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  58.27 
 
 		 147 aa  163  8e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  57.55 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  59.29 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  56.83 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  54.68 
 
 		 146 aa  157  6e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  57.25 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  56.52 
 
 		 142 aa  153  6e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  56.12 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  56.12 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  56.52 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  54.74 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  55.07 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  55.8 
 
 		 142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  55.07 
 
 		 142 aa  150  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  52.86 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  55.4 
 
 		 142 aa  148  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  54.35 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  51.8 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  54.35 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  53.62 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  54.96 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  52.14 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  52.9 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  54.89 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  53.33 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  52.59 
 
 		 142 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  52.52 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  63.51 
 
 		 661 aa  87.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  34.75 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  35.71 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  37.5 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  39.64 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  35.79 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  32.35 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  37.08 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  38.3 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  38.1 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  38.3 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  32.35 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  41.56 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  33.64 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  35.71 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  39.02 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1166  ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000185152  unclonable  0.0000000295483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  34.69 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  34.69 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  33.33 
 
 		 124 aa  51.6  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  34.38 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  36.26 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  35.56 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  36.96 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  31 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  36.96 
 
 		 123 aa  51.2  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  34.69 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  34.69 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  37.04 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  35.48 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  37 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  31.91 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  35.56 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  29.55 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  39.24 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  34.44 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  33.67 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  36.67 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1683  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  34.07 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  31.91 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  31.91 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  36.26 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0159  30S ribosomal protein S12  32.29 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000153549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  31.91 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  31.91 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  35.87 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  31.91 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  35.42 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  39.24 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0661  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291952  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0693  30S ribosomal protein S12  34.02 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000127901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>