More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0677 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0677  30S ribosomal protein S12P  100 
 
 		 147 aa  294  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1306  30S ribosomal protein S12P  92.52 
 
 		 147 aa  277  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0211  30S ribosomal protein S12P  92.52 
 
 		 147 aa  276  7e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0612  30S ribosomal protein S12P  91.84 
 
 		 147 aa  275  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0785  30S ribosomal protein S12P  89.8 
 
 		 147 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0281  30S ribosomal protein S12P  64.63 
 
 		 147 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0070  ribosomal protein S23 (S12)  71.32 
 
 		 142 aa  187  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000707157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2207  30S ribosomal protein S12P  68.35 
 
 		 142 aa  184  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.513202  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1173  30S ribosomal protein S12P  63.83 
 
 		 142 aa  183  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000030185  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0038  30S ribosomal protein S12P  61.27 
 
 		 146 aa  182  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000314149  normal  0.098925 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1199  ribosomal protein S23 (S12)  62.5 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0354  30S ribosomal protein S12P  64.34 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3688  30S ribosomal protein S12P  64.29 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.176389 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0265  30S ribosomal protein S12P  65.71 
 
 		 142 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0033  30S ribosomal protein S12P  66.92 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1615  30S ribosomal protein S12P  65 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729844 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2383  30S ribosomal protein S12P  65.44 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0101  30S ribosomal protein S12P  64.71 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.322935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2096  30S ribosomal protein S12P  58.5 
 
 		 147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0358  ribosomal protein S23 (S12)  63.24 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1968  30S ribosomal protein S12P  58.5 
 
 		 147 aa  170  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000106893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0510  30S ribosomal protein S12P  63.97 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0281  30S ribosomal protein S12P  61.43 
 
 		 142 aa  170  6.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0382587  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2157  ribosomal protein S23 (S12)  62.5 
 
 		 142 aa  170  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2830  30S ribosomal protein S12P  62.14 
 
 		 142 aa  166  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0698  30S ribosomal protein S12P  57.82 
 
 		 147 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00910489  normal  0.0527609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2326  30S ribosomal protein S12P  57.82 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000000138324  hitchhiker  0.00000152235 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01345  40S ribosomal protein S23 (Broad)  54.93 
 
 		 145 aa  148  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04360  40s ribosomal protein s23, putative  54.23 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.203835  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87868  predicted protein  51.41 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50701  predicted protein  52.9 
 
 		 143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32119  Ribosomal protein S23, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  51.88 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0872909  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0322  ribosomal protein S12/S23  56.25 
 
 		 661 aa  91.3  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.497912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  42.11 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  37.25 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  42.86 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  42.86 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  37.27 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86106  conserved hypothetical protein  39.77 
 
 		 177 aa  57  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377423  normal  0.0811608 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4000  ribosomal protein S12  42.22 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000197086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  42.22 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0187  ribosomal protein S12  42.86 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2160  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174142  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16280  SSU ribosomal protein S12P  41.11 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000991521  hitchhiker  0.0000080182 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  41.11 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0958  ribosomal protein S12  40 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000110265  hitchhiker  0.00000000399802 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  40 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  36.84 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  41.11 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  38.46 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  36.54 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  37.25 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  40.22 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  40.24 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  40.24 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  40.24 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  31.13 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  40 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  38.78 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0230  30S ribosomal protein S12  37.89 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0585  30S ribosomal protein S12  39.36 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.940946 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  37.78 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  40.74 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  35.56 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1287  30S ribosomal protein S12  40.48 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000777743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  35.14 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0575  30S ribosomal protein S12  38.64 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  38.54 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  41.11 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1399  30S ribosomal protein S12  40.48 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000381794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  37.63 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  37.11 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  33.33 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2014  30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  39.77 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1929  30S ribosomal protein S12  38.71 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  38.89 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0557  30S ribosomal protein S12  37.74 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.563691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  40.24 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>