More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0127 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0127  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1942  30S ribosomal protein S12  68.66 
 
 		 134 aa  194  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4339  30S ribosomal protein S12  68.89 
 
 		 137 aa  193  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.681919  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  71.9 
 
 		 137 aa  190  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  71.07 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 135 aa  186  8e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  70.25 
 
 		 137 aa  184  5e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  70.25 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0401  30S ribosomal protein S12  67.77 
 
 		 127 aa  177  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  67.46 
 
 		 126 aa  176  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  64.44 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  63.7 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  62.5 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 124 aa  174  4e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  66.13 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  66.12 
 
 		 123 aa  173  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  66.12 
 
 		 123 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  65.87 
 
 		 125 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  65.29 
 
 		 124 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1143  30S ribosomal protein S12  66.12 
 
 		 134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000369356  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 123 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  62.22 
 
 		 135 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  65.32 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  66.39 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  66.12 
 
 		 124 aa  170  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 124 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  64.34 
 
 		 128 aa  169  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 127 aa  169  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  64.12 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0473  ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0264354  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19521  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0323  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 		 124 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436822  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 123 aa  169  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0862  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000541183  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  65.62 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1897  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113502  normal  0.324769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1077  30S ribosomal protein S12  65.83 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  66.14 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2187  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000672266  normal  0.0265681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  63.64 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  63.64 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  65.62 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 124 aa  167  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  65.62 
 
 		 128 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  62.22 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2019  30S ribosomal protein S12  65.83 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 123 aa  167  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  65.29 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  63.64 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  66.12 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 123 aa  167  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  65.08 
 
 		 128 aa  167  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0389  30S ribosomal protein S12  63.49 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0364  30S ribosomal protein S12  63.49 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  63.57 
 
 		 137 aa  167  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  66.94 
 
 		 124 aa  166  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  63.64 
 
 		 124 aa  167  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1313  30S ribosomal protein S12  66.12 
 
 		 127 aa  167  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00377072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  62.4 
 
 		 125 aa  166  8e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 135 aa  166  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 123 aa  166  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  64.52 
 
 		 124 aa  166  9e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 127 aa  166  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  65.29 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  65 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  64.46 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  63.64 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  64.46 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  63.93 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>