More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1831 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1831  ribosomal protein S12  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.658439999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  74.8 
 
 		 125 aa  192  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  74.19 
 
 		 124 aa  191  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 124 aa  190  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  189  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 123 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 125 aa  187  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  186  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4449  ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  186  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  69.34 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3333  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70711e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0928  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 123 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000041416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1907  30S ribosomal protein S12  70.49 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 123 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0189  30S ribosomal protein S12  74.38 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000258978  decreased coverage  0.00196301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 123 aa  184  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  68.61 
 
 		 140 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 124 aa  184  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 123 aa  183  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  69.11 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 127 aa  182  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 129 aa  182  9e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  69.11 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1221  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000786754  hitchhiker  0.00402882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  71.77 
 
 		 125 aa  182  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0595  30S ribosomal protein S12  73.17 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0355  ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000759048  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16341  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 123 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.369961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 127 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 136 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17141  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.387317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 123 aa  181  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0268  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 125 aa  181  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000012453  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0273  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 125 aa  181  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0102222  hitchhiker  0.00000133028 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 124 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1603  30S ribosomal protein S12  69.11 
 
 		 124 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0451  30S ribosomal protein S12  69.35 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0511  30S ribosomal protein S12  69.35 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1444  30S ribosomal protein S12  69.35 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0540  30S ribosomal protein S12  69.35 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  69.11 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0386  30S ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0122913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16911  30S ribosomal protein S12  69.11 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  70.73 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1143  ribosomal protein S12  72.36 
 
 		 135 aa  180  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.584147  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3166  30S ribosomal protein S12  71.9 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.935823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  70.97 
 
 		 126 aa  180  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05695  putative 30S ribosomal protein S12  71.54 
 
 		 124 aa  180  7e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  71.77 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  70.16 
 
 		 125 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1660  30S ribosomal protein S12  69.92 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1950  30S ribosomal protein S12  69.42 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.913755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  71.77 
 
 		 125 aa  179  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>