More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0855 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0855  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 102 aa  204  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.638007  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  99.02 
 
 		 123 aa  203  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6619  30S ribosomal protein S12  90.1 
 
 		 124 aa  186  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03930  30S ribosomal protein S12  90.1 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0622  ribosomal protein S12  92.08 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  93.94 
 
 		 122 aa  184  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0582  ribosomal protein S12  91.09 
 
 		 124 aa  184  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114557  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5078  30S ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 124 aa  183  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.621439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0921  30S ribosomal protein S12  91.09 
 
 		 124 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1279  30S ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 124 aa  183  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29810  SSU ribosomal protein S12P  89.11 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.378005 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0301  30S ribosomal protein S12  89.11 
 
 		 124 aa  183  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000933242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3806  ribosomal protein S12  89.9 
 
 		 123 aa  183  7e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.800192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3469  ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329977  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0577  30S ribosomal protein S12  91.09 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6054  30S ribosomal protein S12  91.09 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3925  30S ribosomal protein S12  90.1 
 
 		 124 aa  183  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2651  30S ribosomal protein S12  91.09 
 
 		 123 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1115  ribosomal protein S12  90.1 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17230  30S ribosomal protein S12  89.11 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1180  30S ribosomal protein S12  90.1 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275804  normal  0.0539297 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0984  30S ribosomal protein S12  87.13 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0682  30S ribosomal protein S12  89.11 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1002  30S ribosomal protein S12  87.13 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1012  30S ribosomal protein S12  87.13 
 
 		 124 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4326  ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 139 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4512  ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10696  30S ribosomal protein S12  87.13 
 
 		 124 aa  181  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3928  30S ribosomal protein S12  89.11 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.418026  normal  0.366347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4320  30S ribosomal protein S12  89.11 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 124 aa  179  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5119  ribosomal protein S12  89.11 
 
 		 123 aa  179  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  88.12 
 
 		 124 aa  179  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0801  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.208097  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23900  SSU ribosomal protein S12P  87.13 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20930  SSU ribosomal protein S12P  89.11 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.6321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 123 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 125 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1770  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 123 aa  177  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0593417  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 125 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0393  ribosomal protein S12  87.13 
 
 		 123 aa  177  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.844601  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 127 aa  177  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 127 aa  176  7e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0284  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 136 aa  176  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000309063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1081  ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.453767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2234  30S ribosomal protein S12  85.86 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000995166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  80.2 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1873  30S ribosomal protein S12  86.6 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.474423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 125 aa  174  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3148  ribosomal protein S12  86.14 
 
 		 124 aa  174  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1606  ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.524218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01120  ribosomal protein S12  85.15 
 
 		 123 aa  174  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.14602e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  83.67 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 124 aa  174  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3800  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 125 aa  174  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000117431  n/a   
 
 
 
NC_013422  Hneap_0318  ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 125 aa  174  5e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000292606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  83.67 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  81.19 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  81.19 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  81.19 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  81.19 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1426  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0159812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  81.19 
 
 		 123 aa  173  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  81.19 
 
 		 123 aa  173  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23611  30S ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 125 aa  173  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.436727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2912  ribosomal protein S12  85.86 
 
 		 137 aa  173  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000187241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  80.2 
 
 		 123 aa  173  8e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0762  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 125 aa  173  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17021  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4920  ribosomal protein S12  82.18 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  84.16 
 
 		 123 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  83.17 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>