More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0587 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  54.44 
 
 
1098 aa  1022    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
1381 aa  2815    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  41.2 
 
 
1272 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  43.16 
 
 
903 aa  524  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  42.65 
 
 
879 aa  494  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  42.25 
 
 
945 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  37.22 
 
 
874 aa  436  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  36.53 
 
 
844 aa  389  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  34.3 
 
 
1118 aa  363  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  62.14 
 
 
610 aa  360  7e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  61.79 
 
 
610 aa  357  5.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  42.79 
 
 
849 aa  316  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  64.38 
 
 
465 aa  303  1e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  46.75 
 
 
2605 aa  294  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  59.59 
 
 
461 aa  293  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  59.13 
 
 
472 aa  291  4e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  62.27 
 
 
461 aa  287  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  58.93 
 
 
470 aa  277  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  56.65 
 
 
465 aa  267  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  59.64 
 
 
465 aa  267  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  60.18 
 
 
464 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  56.65 
 
 
465 aa  266  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  60.18 
 
 
464 aa  266  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  58.01 
 
 
465 aa  265  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  55.79 
 
 
465 aa  263  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  57.8 
 
 
463 aa  263  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  55.36 
 
 
462 aa  262  3e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  59.64 
 
 
464 aa  262  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  57.34 
 
 
462 aa  261  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  58.3 
 
 
464 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  58.3 
 
 
464 aa  261  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  57.34 
 
 
463 aa  260  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  56.05 
 
 
462 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  53.28 
 
 
468 aa  260  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  56.05 
 
 
462 aa  259  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  56.22 
 
 
463 aa  259  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  55.2 
 
 
468 aa  259  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  55.2 
 
 
468 aa  259  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  54.75 
 
 
468 aa  258  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  56.42 
 
 
473 aa  257  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  54.71 
 
 
468 aa  255  4.0000000000000004e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  58.3 
 
 
463 aa  254  7e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  53.64 
 
 
468 aa  254  9.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  254  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  252  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
468 aa  252  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  53.81 
 
 
468 aa  251  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  53.71 
 
 
460 aa  249  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  54.09 
 
 
472 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  53.18 
 
 
468 aa  249  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  53.42 
 
 
470 aa  249  3e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  53.28 
 
 
460 aa  248  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  51.74 
 
 
468 aa  249  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  55.2 
 
 
469 aa  246  3e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  43.75 
 
 
821 aa  246  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  51.82 
 
 
478 aa  246  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00018  replicative DNA helicase  52.21 
 
 
466 aa  245  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  54.79 
 
 
476 aa  244  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  52.21 
 
 
466 aa  244  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  47.14 
 
 
831 aa  244  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  55.5 
 
 
458 aa  244  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  54.84 
 
 
457 aa  243  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  52.63 
 
 
473 aa  243  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  54.84 
 
 
457 aa  243  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  54.79 
 
 
476 aa  243  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  51.75 
 
 
467 aa  242  4e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  53.74 
 
 
479 aa  241  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  53.39 
 
 
468 aa  241  8e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  50.87 
 
 
465 aa  240  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  53.39 
 
 
468 aa  239  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  53.12 
 
 
461 aa  239  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  46.26 
 
 
807 aa  240  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  54.59 
 
 
460 aa  240  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  53.12 
 
 
461 aa  239  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  53.67 
 
 
460 aa  239  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  53.67 
 
 
460 aa  239  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  53.67 
 
 
460 aa  239  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  53.67 
 
 
460 aa  239  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  53.67 
 
 
460 aa  239  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  52.97 
 
 
471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
471 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
471 aa  238  6e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  52.51 
 
 
471 aa  238  6e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  53.67 
 
 
460 aa  238  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  53.12 
 
 
462 aa  238  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>