More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2037 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  100 
 
 		 849 aa  1729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  38.28 
 
 		 1272 aa  542  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  33.33 
 
 		 831 aa  363  5.0000000000000005e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  68.53 
 
 		 446 aa  351  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  68.31 
 
 		 437 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  43.63 
 
 		 1098 aa  325  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 1381 aa  316  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  56.79 
 
 		 442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  55.56 
 
 		 441 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  56.28 
 
 		 463 aa  270  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  56.2 
 
 		 446 aa  270  8.999999999999999e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  56.5 
 
 		 449 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  52.44 
 
 		 461 aa  269  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  56.56 
 
 		 440 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  53.5 
 
 		 447 aa  268  4e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  56.43 
 
 		 444 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  56.43 
 
 		 439 aa  267  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  56.73 
 
 		 473 aa  266  8.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  55.47 
 
 		 470 aa  266  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  55.97 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  55.69 
 
 		 449 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  48.94 
 
 		 465 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 464 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.77 
 
 		 449 aa  263  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  54.29 
 
 		 460 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  51.84 
 
 		 465 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 464 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 465 aa  261  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  54.32 
 
 		 473 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  55.33 
 
 		 463 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 449 aa  261  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 318 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  50.61 
 
 		 464 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  52.02 
 
 		 471 aa  260  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  52.02 
 
 		 471 aa  260  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 453 aa  260  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  54.13 
 
 		 459 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  53.91 
 
 		 472 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  47.48 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  54.73 
 
 		 442 aa  259  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  47.87 
 
 		 465 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  53.1 
 
 		 466 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  50.82 
 
 		 464 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  53.1 
 
 		 466 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  47.87 
 
 		 465 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  47.83 
 
 		 460 aa  258  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  47.83 
 
 		 460 aa  258  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  50.61 
 
 		 472 aa  258  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  52.87 
 
 		 462 aa  258  4e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  51.01 
 
 		 462 aa  258  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  50.82 
 
 		 464 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  50.2 
 
 		 458 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  54.1 
 
 		 470 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  54.47 
 
 		 442 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  54.13 
 
 		 445 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  54.73 
 
 		 463 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  55.14 
 
 		 454 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  55.92 
 
 		 471 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 466 aa  255  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  51.81 
 
 		 476 aa  255  3e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  52.46 
 
 		 465 aa  255  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  49.39 
 
 		 463 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  52.85 
 
 		 450 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  51.44 
 
 		 461 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  56.02 
 
 		 879 aa  254  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  54.96 
 
 		 446 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  52.92 
 
 		 448 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  54.73 
 
 		 454 aa  254  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  52.03 
 
 		 444 aa  253  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  51.81 
 
 		 476 aa  254  7e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  52.89 
 
 		 444 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  53.91 
 
 		 477 aa  253  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  54.13 
 
 		 473 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  52.48 
 
 		 444 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 457 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  52.85 
 
 		 481 aa  252  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  52.67 
 
 		 456 aa  253  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  54.55 
 
 		 462 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  54.55 
 
 		 462 aa  252  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  51.61 
 
 		 457 aa  252  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0905  replicative DNA helicase  51.01 
 
 		 479 aa  251  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000163785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  54.18 
 
 		 473 aa  251  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  53.5 
 
 		 454 aa  251  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  52.24 
 
 		 470 aa  251  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  51.42 
 
 		 469 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  54.22 
 
 		 444 aa  249  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.36 
 
 		 456 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  51.59 
 
 		 821 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  54.22 
 
 		 444 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  51.44 
 
 		 466 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  50.81 
 
 		 467 aa  248  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  55.14 
 
 		 472 aa  248  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>