More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2211 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  100 
 
 
442 aa  880    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  61.33 
 
 
441 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  61.1 
 
 
440 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  58.24 
 
 
448 aa  538  9.999999999999999e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  57.05 
 
 
444 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  55.45 
 
 
444 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  59.22 
 
 
441 aa  505  9.999999999999999e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  52.16 
 
 
442 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  52.18 
 
 
445 aa  483  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  52.16 
 
 
453 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50.91 
 
 
446 aa  481  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  52.86 
 
 
459 aa  479  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  53.9 
 
 
453 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  52.16 
 
 
449 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  53.78 
 
 
454 aa  478  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  51.94 
 
 
453 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  52.49 
 
 
446 aa  473  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  54 
 
 
454 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  50.11 
 
 
456 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  52.58 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  51.5 
 
 
447 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  48.99 
 
 
449 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  46.91 
 
 
442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  49.78 
 
 
456 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  48.11 
 
 
456 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  50 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  48.39 
 
 
449 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  48.96 
 
 
445 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  48.65 
 
 
458 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
456 aa  432  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  49.77 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  49.54 
 
 
481 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  49.77 
 
 
464 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
461 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  46.82 
 
 
457 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  52.29 
 
 
461 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  49.43 
 
 
443 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  50.92 
 
 
444 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  47.2 
 
 
443 aa  424  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  47.25 
 
 
454 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.37 
 
 
444 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  46.37 
 
 
439 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  48.62 
 
 
464 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  50.8 
 
 
450 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
464 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  50.57 
 
 
465 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  46.61 
 
 
481 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  51.49 
 
 
463 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
469 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  47.7 
 
 
463 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  48.07 
 
 
446 aa  419  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  48.18 
 
 
469 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  48.51 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  45.62 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  48.74 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  47 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
465 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  45.62 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  50.23 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  48.85 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  48.86 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
465 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
466 aa  411  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
460 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  47.91 
 
 
454 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
470 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  47.84 
 
 
468 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  48.39 
 
 
457 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  50.8 
 
 
463 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
460 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
462 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
462 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  48.39 
 
 
457 aa  413  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
460 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  49.08 
 
 
465 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  49.09 
 
 
471 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  48.17 
 
 
473 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  50.45 
 
 
473 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.58 
 
 
456 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
460 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  47.02 
 
 
452 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
461 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  48.85 
 
 
472 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
461 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  48.16 
 
 
452 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  48.85 
 
 
472 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>