More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0852 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  100 
 
 
443 aa  892    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  51.93 
 
 
442 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  52.48 
 
 
459 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  49.21 
 
 
445 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  50.23 
 
 
441 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  50.45 
 
 
447 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.07 
 
 
446 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
440 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
442 aa  435  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.21 
 
 
444 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  48.62 
 
 
448 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  47.13 
 
 
439 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  50.23 
 
 
444 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.9 
 
 
444 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  48.53 
 
 
449 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.85 
 
 
454 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
449 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.85 
 
 
454 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  47.5 
 
 
454 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  47.29 
 
 
442 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  47.07 
 
 
449 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  46.61 
 
 
481 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  48.18 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.54 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.46 
 
 
456 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  46.31 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.36 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  44.59 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  45.05 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  45.96 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  45.8 
 
 
449 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  46.58 
 
 
456 aa  398  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  44.65 
 
 
454 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  46.01 
 
 
465 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  45.6 
 
 
455 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
446 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  45.23 
 
 
451 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  45.84 
 
 
453 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  47.61 
 
 
452 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  45.88 
 
 
468 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  46.5 
 
 
481 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  44.47 
 
 
461 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  46.92 
 
 
452 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  47.61 
 
 
450 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  45.48 
 
 
457 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  46.97 
 
 
460 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  44.37 
 
 
469 aa  388  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
460 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  44.65 
 
 
453 aa  391  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  46.97 
 
 
460 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
458 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  46.52 
 
 
460 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
460 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  46.97 
 
 
460 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  44.09 
 
 
445 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.93 
 
 
458 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  43.08 
 
 
472 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  45.96 
 
 
476 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  46.52 
 
 
469 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  44.87 
 
 
468 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  44.52 
 
 
473 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  46.64 
 
 
474 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  46.88 
 
 
473 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  46.07 
 
 
462 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  45.96 
 
 
472 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
529 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  46.52 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  44.84 
 
 
462 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
460 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  46.4 
 
 
452 aa  388  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  45.96 
 
 
472 aa  385  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
471 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  42.99 
 
 
470 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  45.52 
 
 
472 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  44.02 
 
 
443 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
471 aa  385  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
461 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
462 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
461 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
463 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
477 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
462 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  44.42 
 
 
444 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.52 
 
 
476 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>