More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0998 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  100 
 
 		 456 aa  940    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  67.26 
 
 		 456 aa  638    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  69.76 
 
 		 456 aa  672    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  88.6 
 
 		 456 aa  842    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  75.27 
 
 		 449 aa  707    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  69.15 
 
 		 449 aa  653    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  69.15 
 
 		 449 aa  654    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  69.54 
 
 		 458 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  54.79 
 
 		 448 aa  508  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  54.59 
 
 		 445 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  54.49 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  54.57 
 
 		 440 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  54.49 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  54.7 
 
 		 453 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  54.05 
 
 		 453 aa  494  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  54.67 
 
 		 454 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  54.69 
 
 		 445 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  53.61 
 
 		 454 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  52.43 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  52.91 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  52.78 
 
 		 444 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  51.77 
 
 		 444 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  53.36 
 
 		 481 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 441 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  53.22 
 
 		 461 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  54.63 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  54.36 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  52.8 
 
 		 460 aa  458  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  54.04 
 
 		 456 aa  458  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  53.96 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  54.63 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  53.35 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  54.63 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  448  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  54.63 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  54.32 
 
 		 473 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  52.41 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  53.51 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  53.51 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  51.9 
 
 		 508 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  53.73 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  53.51 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  51.63 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  53.78 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  52.63 
 
 		 470 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  52.85 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  53.78 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  54 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  53.78 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  54 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  53.63 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 464 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  51.99 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  52.21 
 
 		 460 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  52.35 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  50.78 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  51.68 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  52.34 
 
 		 467 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  51 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  50.66 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  52.56 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  52.44 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  51 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  50 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  51.21 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  52.34 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  52.67 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  52.56 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  52.34 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  50 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>