More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1995 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  67.26 
 
 		 456 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  100 
 
 		 456 aa  936    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  67.11 
 
 		 456 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  64.22 
 
 		 456 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  66.01 
 
 		 449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  63.46 
 
 		 458 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  64.25 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  63.82 
 
 		 449 aa  594  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  52.67 
 
 		 448 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  53.35 
 
 		 440 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  52.82 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  51.9 
 
 		 441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  53.1 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  53.14 
 
 		 445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  51.7 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  52.31 
 
 		 454 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 444 aa  464  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  53.79 
 
 		 465 aa  458  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 446 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 454 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  51.24 
 
 		 444 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  50.9 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  51.44 
 
 		 460 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  51.12 
 
 		 461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  49.57 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  49 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 462 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  51 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  48.31 
 
 		 442 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 462 aa  435  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  52.02 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  50.55 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 447 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  50.78 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 463 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  50.67 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  50.66 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  49.12 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  49.11 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  47.48 
 
 		 442 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  51.43 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  49.67 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 467 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  49.67 
 
 		 462 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  47.02 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  49.22 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  49.45 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  51.21 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  49.45 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  49.45 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 468 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  49.11 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  50.77 
 
 		 451 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  49.45 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  50 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  50.99 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  49.01 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  50 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  47.22 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>