More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1827 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  65.8 
 
 
481 aa  644    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  100 
 
 
481 aa  985    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  64.98 
 
 
456 aa  614  1e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  66 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  64.43 
 
 
450 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  57.7 
 
 
508 aa  550  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  54.57 
 
 
445 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  53.36 
 
 
456 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  52.47 
 
 
456 aa  474  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  51.95 
 
 
445 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  52.36 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
465 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  52.97 
 
 
476 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  50.33 
 
 
456 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  52.74 
 
 
476 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  54.11 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  50.78 
 
 
460 aa  455  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  49.78 
 
 
458 aa  455  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  49.77 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  50.78 
 
 
460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  52.05 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  52.05 
 
 
471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  50 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  50.9 
 
 
456 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  49.77 
 
 
449 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  49.55 
 
 
471 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  48.94 
 
 
472 aa  444  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
444 aa  442  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
453 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
446 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  46.82 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  52.37 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  52.37 
 
 
462 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  50.8 
 
 
461 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  52.25 
 
 
473 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
442 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  51.81 
 
 
463 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  50 
 
 
462 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  51.47 
 
 
460 aa  435  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  51.4 
 
 
460 aa  436  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  48.91 
 
 
472 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  51.47 
 
 
460 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  51.25 
 
 
460 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.4 
 
 
444 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  51.81 
 
 
463 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  51.47 
 
 
460 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  49.08 
 
 
448 aa  432  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  51.25 
 
 
460 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  51.47 
 
 
460 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  49.54 
 
 
442 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  51.02 
 
 
460 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
453 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
462 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
453 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
453 aa  430  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
453 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47.29 
 
 
449 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  47.43 
 
 
453 aa  428  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  50.57 
 
 
465 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
453 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  52.09 
 
 
473 aa  431  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  47.51 
 
 
453 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
460 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
461 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  50 
 
 
454 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  47.25 
 
 
453 aa  429  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  47.48 
 
 
453 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
461 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
468 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  50.11 
 
 
464 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
464 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
446 aa  425  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  50 
 
 
477 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  50 
 
 
454 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
464 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
451 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
468 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  50.57 
 
 
473 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  49.44 
 
 
469 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  50.11 
 
 
468 aa  422  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  49.1 
 
 
468 aa  424  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  50.11 
 
 
464 aa  425  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
459 aa  424  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  48.21 
 
 
468 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  49.77 
 
 
462 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
472 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  49.1 
 
 
468 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  49.1 
 
 
468 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  49.66 
 
 
468 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  49.1 
 
 
468 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.34 
 
 
463 aa  420  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  49.44 
 
 
467 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  48.3 
 
 
464 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  51.25 
 
 
472 aa  422  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>