More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2568 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  88.6 
 
 		 456 aa  842    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  76.15 
 
 		 449 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  68.49 
 
 		 449 aa  646    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  67.11 
 
 		 456 aa  639    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  100 
 
 		 456 aa  938    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  68.71 
 
 		 449 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  69.76 
 
 		 456 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  68.2 
 
 		 458 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  55.83 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  54.79 
 
 		 448 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  54.44 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  54.27 
 
 		 453 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  53.57 
 
 		 445 aa  491  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 446 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  54.12 
 
 		 440 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  52.95 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 453 aa  488  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  53.17 
 
 		 454 aa  489  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  52.95 
 
 		 453 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  53.78 
 
 		 442 aa  485  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  52.78 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 441 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  54.46 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  52.47 
 
 		 481 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  52.77 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 459 aa  460  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  52.9 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  53.14 
 
 		 456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  51.9 
 
 		 460 aa  450  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  52.13 
 
 		 447 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  52.64 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  51.32 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  53.08 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  51.19 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  47.99 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  47.99 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  51.56 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  52.64 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  50.66 
 
 		 460 aa  439  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  51.1 
 
 		 463 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  52.46 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  51.56 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  52.64 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  51.45 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  50.89 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  52.33 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  50.44 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  51.12 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  50.67 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  51.64 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  50.67 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  51.12 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  50.67 
 
 		 472 aa  435  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  51.9 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  50.66 
 
 		 460 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  47.68 
 
 		 466 aa  431  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  49.67 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  47.68 
 
 		 466 aa  431  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  50.78 
 
 		 458 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  50.88 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 508 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  51 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  50.89 
 
 		 460 aa  428  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  50 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  50.78 
 
 		 468 aa  430  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>