More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2648 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  99.77 
 
 		 444 aa  898    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  100 
 
 		 439 aa  899    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  56.25 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  56.44 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  56.15 
 
 		 445 aa  511  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  52.55 
 
 		 454 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  52.2 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  52.08 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  51.03 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  49.66 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  49.32 
 
 		 449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  49.55 
 
 		 453 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  51.27 
 
 		 447 aa  464  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  51.04 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  50.8 
 
 		 444 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  51.05 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.87 
 
 		 459 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  48.9 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  48.9 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.02 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  50.7 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.99 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.88 
 
 		 456 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.25 
 
 		 444 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  45.96 
 
 		 454 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  48.64 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.37 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  49.09 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  47.13 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  48.14 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  47.95 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  48.18 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  48.18 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  48.18 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.67 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  45.03 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  48.18 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  47.95 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  47.95 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  47.95 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 458 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4207  replicative DNA helicase  48.18 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507576  hitchhiker  0.000100726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  45.8 
 
 		 464 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 463 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  43.71 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  47.73 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  46.8 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.99 
 
 		 446 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  46.56 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  46.01 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  47.02 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0762  replicative DNA helicase  47.27 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000711425  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  45.31 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  45.31 
 
 		 460 aa  413  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.15 
 
 		 453 aa  414  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  47.29 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  46 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  45.6 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  46.92 
 
 		 456 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  45.8 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.69 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.64 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 465 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  45.87 
 
 		 465 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  46.51 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  47.5 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  45.54 
 
 		 478 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  47.27 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  45.18 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  43.25 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  45.98 
 
 		 476 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.75 
 
 		 476 aa  407  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  46.1 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  45.18 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  45.14 
 
 		 452 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.16 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  43.78 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  45.89 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  45.89 
 
 		 457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.84 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3058  replicative DNA helicase  47.73 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000123089  normal  0.262766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  46.22 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  46.94 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  43.06 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  45.18 
 
 		 465 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  43.81 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  46.38 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  45 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  45.91 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>