More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0082 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  100 
 
 		 446 aa  913    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  78.25 
 
 		 445 aa  757    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  64.38 
 
 		 442 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  60.78 
 
 		 447 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  57.08 
 
 		 444 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  58.31 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  57.31 
 
 		 440 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  55.38 
 
 		 459 aa  522  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  56.25 
 
 		 439 aa  518  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  55.08 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  56.65 
 
 		 454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  56.19 
 
 		 454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  56.25 
 
 		 444 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  55.02 
 
 		 441 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  55.53 
 
 		 444 aa  509  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  53.9 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  53.9 
 
 		 453 aa  508  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  54.13 
 
 		 453 aa  509  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  53.67 
 
 		 453 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 446 aa  496  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  52.12 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  52.47 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  51.22 
 
 		 456 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  50.91 
 
 		 442 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  52.48 
 
 		 449 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  52.7 
 
 		 449 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  49.2 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  51.33 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  52.05 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  46.85 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  50.79 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  48.97 
 
 		 451 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  51.49 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  51.83 
 
 		 476 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 453 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  50.33 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  50.68 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  47.37 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  49.31 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  51.59 
 
 		 443 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  47.02 
 
 		 453 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  47.47 
 
 		 449 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.34 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  46.83 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  48.97 
 
 		 454 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  50.34 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  50.56 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  48.05 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  51.67 
 
 		 451 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  47.47 
 
 		 452 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  49.32 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  48.88 
 
 		 513 aa  441  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  50.91 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  49.54 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  49.2 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  50.8 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  49.2 
 
 		 465 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  49.2 
 
 		 450 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  50 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  48.97 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  49.66 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  52.06 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  47.35 
 
 		 522 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  47.47 
 
 		 452 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  49.43 
 
 		 508 aa  435  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  48.07 
 
 		 443 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  48.17 
 
 		 444 aa  435  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  48.97 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  46.79 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  48.51 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  48.74 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  45.79 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  49.2 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  48.51 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  45.93 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  48.17 
 
 		 444 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  50.57 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  47.86 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  48.51 
 
 		 468 aa  429  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  49.54 
 
 		 456 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  48.97 
 
 		 470 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  46.88 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  48.76 
 
 		 509 aa  430  1e-119  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>