More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0019 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  73.06 
 
 		 452 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  100 
 
 		 449 aa  914    Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  77.43 
 
 		 451 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  69.82 
 
 		 459 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  72.48 
 
 		 461 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  71.36 
 
 		 461 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  71.56 
 
 		 452 aa  648    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  80.55 
 
 		 454 aa  735    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  70.94 
 
 		 457 aa  648    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  72.62 
 
 		 460 aa  677    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  71.43 
 
 		 460 aa  655    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  75.92 
 
 		 452 aa  683    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  72.71 
 
 		 453 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  68.97 
 
 		 457 aa  634  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  68.06 
 
 		 462 aa  624  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  66.74 
 
 		 468 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  67.27 
 
 		 469 aa  624  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  67.58 
 
 		 460 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  66.36 
 
 		 455 aa  613  9.999999999999999e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  66.59 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  64.38 
 
 		 480 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  66.28 
 
 		 448 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  66.28 
 
 		 464 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  65.75 
 
 		 464 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  68.77 
 
 		 903 aa  552  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  61.59 
 
 		 844 aa  532  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  65.73 
 
 		 874 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  58.24 
 
 		 481 aa  526  1e-148  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  57.21 
 
 		 509 aa  508  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.47 
 
 		 446 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  46.9 
 
 		 445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.85 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  87.76 
 
 		 865 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.37 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.44 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.29 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  46.21 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  45.06 
 
 		 449 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.37 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.5 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 453 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.83 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.15 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.36 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.65 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.91 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  46.17 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.85 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  45.86 
 
 		 458 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  45.08 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.65 
 
 		 442 aa  415  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.47 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.06 
 
 		 444 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.06 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  44.95 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 447 aa  408  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  41.82 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.89 
 
 		 476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  44.59 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  45.79 
 
 		 447 aa  402  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  45.39 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44.77 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  87.17 
 
 		 939 aa  402  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  45.43 
 
 		 476 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  45.08 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  45.79 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.48 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  45.79 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  41.94 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  45.08 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.82 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  45.8 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  41.34 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  48.51 
 
 		 441 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.96 
 
 		 461 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 461 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 529 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  42.54 
 
 		 478 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2895  DnaB domain protein helicase domain protein  45.88 
 
 		 448 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213935  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 508 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.56 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  42.73 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  41.29 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  41.91 
 
 		 446 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  41.8 
 
 		 470 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  42.14 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  42.7 
 
 		 522 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  42.4 
 
 		 509 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>