More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4838 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  56.18 
 
 		 772 aa  893    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  50.06 
 
 		 832 aa  808    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  62.92 
 
 		 879 aa  1107    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  63.34 
 
 		 871 aa  1100    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  100 
 
 		 865 aa  1766    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  56.96 
 
 		 824 aa  928    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  63.38 
 
 		 863 aa  1113    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  65.98 
 
 		 782 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  65.98 
 
 		 782 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  59.9 
 
 		 1118 aa  495  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  36.95 
 
 		 807 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  69.09 
 
 		 939 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  87.76 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  61.84 
 
 		 749 aa  422  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  33.41 
 
 		 831 aa  417  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  81.07 
 
 		 454 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  79.1 
 
 		 451 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  75.3 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  74.79 
 
 		 453 aa  373  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  80.09 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  73.66 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  77.09 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  73.55 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  73.97 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  77.88 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  77.43 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  74.34 
 
 		 462 aa  359  9.999999999999999e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  74.22 
 
 		 457 aa  355  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  72.81 
 
 		 468 aa  353  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  71.05 
 
 		 469 aa  346  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  69.14 
 
 		 459 aa  345  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  70.61 
 
 		 455 aa  344  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  72.57 
 
 		 474 aa  340  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  69.91 
 
 		 460 aa  335  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  70 
 
 		 448 aa  334  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  70 
 
 		 464 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  68.58 
 
 		 480 aa  328  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  69.3 
 
 		 464 aa  328  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  65.78 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  66.67 
 
 		 509 aa  301  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  63.3 
 
 		 903 aa  290  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  61.33 
 
 		 874 aa  278  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  58.82 
 
 		 844 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  38.46 
 
 		 821 aa  263  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 445 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  49.79 
 
 		 446 aa  251  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  50.21 
 
 		 476 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  49.17 
 
 		 449 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  49.17 
 
 		 453 aa  248  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 318 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  51.09 
 
 		 449 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  8e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.39 
 
 		 441 aa  247  8e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  247  8e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  49.79 
 
 		 476 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  49.79 
 
 		 444 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  49.79 
 
 		 439 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  50 
 
 		 471 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  50 
 
 		 471 aa  246  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  51.09 
 
 		 449 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 444 aa  244  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  51.97 
 
 		 449 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  49.17 
 
 		 481 aa  244  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  48.68 
 
 		 481 aa  243  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.33 
 
 		 442 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  50.83 
 
 		 454 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  47.08 
 
 		 442 aa  241  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  50.42 
 
 		 454 aa  240  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  51.98 
 
 		 460 aa  239  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  51.98 
 
 		 460 aa  239  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  238  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  50 
 
 		 461 aa  238  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  48.78 
 
 		 457 aa  238  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  48.78 
 
 		 457 aa  238  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  48.95 
 
 		 448 aa  237  7e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  47.35 
 
 		 447 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  51.27 
 
 		 456 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.35 
 
 		 442 aa  234  4.0000000000000004e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  48 
 
 		 458 aa  233  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  45.04 
 
 		 440 aa  233  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  49.12 
 
 		 465 aa  233  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  51.79 
 
 		 447 aa  231  3e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  47.08 
 
 		 444 aa  231  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  48.8 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  41.78 
 
 		 471 aa  228  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  48.68 
 
 		 470 aa  228  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  44.75 
 
 		 466 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  44.75 
 
 		 466 aa  228  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  49.34 
 
 		 468 aa  228  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  47.62 
 
 		 446 aa  227  6e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  50.63 
 
 		 456 aa  227  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.36 
 
 		 466 aa  227  7e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  35.11 
 
 		 849 aa  224  4.9999999999999996e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  47.58 
 
 		 468 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>