More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5063 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  59.01 
 
 		 772 aa  978    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  65.45 
 
 		 879 aa  1168    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  54.93 
 
 		 832 aa  886    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  100 
 
 		 871 aa  1787    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  63.34 
 
 		 865 aa  1102    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  59.7 
 
 		 824 aa  1017    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  67.83 
 
 		 863 aa  1201    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  69.82 
 
 		 782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  69.82 
 
 		 782 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  63.71 
 
 		 1118 aa  485  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  63.17 
 
 		 939 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  62.7 
 
 		 749 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  33.03 
 
 		 807 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  78.32 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  77.97 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  57.85 
 
 		 461 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  76.55 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  75.56 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  73.59 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  74.78 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  67.97 
 
 		 460 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  67.84 
 
 		 461 aa  363  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  56.36 
 
 		 457 aa  363  8e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  74.01 
 
 		 452 aa  360  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  65.76 
 
 		 452 aa  355  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  72.25 
 
 		 459 aa  352  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  60.75 
 
 		 455 aa  352  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  73.13 
 
 		 460 aa  350  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  71.11 
 
 		 462 aa  349  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  44.91 
 
 		 457 aa  349  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  66.15 
 
 		 469 aa  347  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  69.33 
 
 		 480 aa  345  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  69.33 
 
 		 468 aa  341  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  64.34 
 
 		 448 aa  337  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  64.34 
 
 		 464 aa  337  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  69.03 
 
 		 464 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  69.87 
 
 		 874 aa  326  9e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  68.58 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  62.3 
 
 		 844 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  65.78 
 
 		 481 aa  303  9e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  65.78 
 
 		 509 aa  303  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  65 
 
 		 903 aa  285  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  42.94 
 
 		 441 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  36.84 
 
 		 821 aa  252  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  50.61 
 
 		 449 aa  249  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  49.19 
 
 		 449 aa  247  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 445 aa  244  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.67 
 
 		 444 aa  243  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  52.44 
 
 		 454 aa  241  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  36.55 
 
 		 831 aa  241  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  48.33 
 
 		 442 aa  240  6.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  50.62 
 
 		 454 aa  240  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  36.5 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  48.76 
 
 		 449 aa  239  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  39.65 
 
 		 442 aa  239  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 318 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 440 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 453 aa  238  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  48.33 
 
 		 444 aa  238  4e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.04 
 
 		 446 aa  238  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  45.9 
 
 		 481 aa  236  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  49.78 
 
 		 453 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.53 
 
 		 448 aa  236  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  48.68 
 
 		 453 aa  236  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  40.24 
 
 		 471 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  38.66 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  48.15 
 
 		 460 aa  235  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  47.54 
 
 		 449 aa  235  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  47.11 
 
 		 481 aa  234  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  47.11 
 
 		 454 aa  233  8.000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.56 
 
 		 442 aa  233  8.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.46 
 
 		 459 aa  232  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  38.08 
 
 		 460 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  49.38 
 
 		 445 aa  232  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  38.08 
 
 		 460 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  38.08 
 
 		 460 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 444 aa  230  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 439 aa  230  9e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  48.47 
 
 		 470 aa  228  3e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  46.69 
 
 		 476 aa  228  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  35.82 
 
 		 472 aa  228  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  44.49 
 
 		 471 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  37.72 
 
 		 468 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.38 
 
 		 465 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  48.51 
 
 		 456 aa  227  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  46.28 
 
 		 476 aa  227  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  48.74 
 
 		 458 aa  227  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  46.69 
 
 		 460 aa  227  8e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  46.69 
 
 		 460 aa  227  8e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  34.79 
 
 		 472 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  46.09 
 
 		 450 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  34.79 
 
 		 472 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  46.75 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>