More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_28971 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  81.53 
 
 
460 aa  782    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  100 
 
 
472 aa  955    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  80.47 
 
 
460 aa  777    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  87.08 
 
 
471 aa  843    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  86.26 
 
 
472 aa  833    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  89.83 
 
 
471 aa  861    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  88.98 
 
 
468 aa  852    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  81.32 
 
 
460 aa  781    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  72.87 
 
 
454 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  86.26 
 
 
472 aa  833    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  81.53 
 
 
460 aa  782    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  64.37 
 
 
450 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  59.82 
 
 
444 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  59.58 
 
 
444 aa  551  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  59.12 
 
 
450 aa  532  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  59.53 
 
 
602 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0029  DnaB helicase  51.25 
 
 
449 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.13 
 
 
446 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  48.74 
 
 
448 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  48.05 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  48.53 
 
 
453 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.47 
 
 
445 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  47.07 
 
 
456 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15351  replicative DNA helicase  66.34 
 
 
307 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  47.39 
 
 
453 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.08 
 
 
444 aa  413  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  46.94 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
453 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47.17 
 
 
449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.85 
 
 
456 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  47.83 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  48.29 
 
 
454 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.92 
 
 
449 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  49.42 
 
 
450 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  48.98 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  46.68 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.87 
 
 
442 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.36 
 
 
442 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.16 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  47.83 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.85 
 
 
454 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  45.48 
 
 
449 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  45.93 
 
 
449 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  46.79 
 
 
481 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  47.95 
 
 
444 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  47.58 
 
 
447 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  45.77 
 
 
459 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.71 
 
 
441 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  47.6 
 
 
465 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  45.8 
 
 
461 aa  382  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  45.14 
 
 
473 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
462 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  45.84 
 
 
456 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  46.46 
 
 
476 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
462 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.49 
 
 
458 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.55 
 
 
444 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.55 
 
 
439 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  46.38 
 
 
476 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
525 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  45.8 
 
 
463 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.05 
 
 
471 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  44.52 
 
 
461 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  44.52 
 
 
461 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  44.96 
 
 
463 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
464 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  372  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  44.87 
 
 
464 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.3 
 
 
460 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  44.14 
 
 
452 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  44.29 
 
 
464 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  44.29 
 
 
465 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.37 
 
 
456 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  44.98 
 
 
461 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  45.33 
 
 
447 aa  366  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  43.57 
 
 
462 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  44.34 
 
 
529 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  44.19 
 
 
463 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  43.47 
 
 
514 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  45.01 
 
 
463 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  46.79 
 
 
450 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  44.75 
 
 
456 aa  364  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
464 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  44.08 
 
 
462 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  43.82 
 
 
470 aa  363  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  42.61 
 
 
472 aa  363  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  44.84 
 
 
522 aa  363  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.64 
 
 
443 aa  363  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  42.37 
 
 
472 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  42.66 
 
 
512 aa  363  5.0000000000000005e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  42.11 
 
 
509 aa  362  6e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  43.84 
 
 
464 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  43.24 
 
 
465 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>