More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4164 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  81.14 
 
 		 459 aa  754    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  68.22 
 
 		 454 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  80.41 
 
 		 874 aa  657    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  78.84 
 
 		 460 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  100 
 
 		 469 aa  949    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  75.95 
 
 		 464 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  66.24 
 
 		 468 aa  645    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  68.17 
 
 		 460 aa  644    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  76.2 
 
 		 448 aa  706    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  68.72 
 
 		 451 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  69.27 
 
 		 452 aa  640    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  68.08 
 
 		 457 aa  634    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  76.2 
 
 		 464 aa  705    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  68.17 
 
 		 453 aa  628  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  68.88 
 
 		 461 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  68.07 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  66.96 
 
 		 455 aa  622  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  67.87 
 
 		 452 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  67.27 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  66.59 
 
 		 449 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  64.67 
 
 		 457 aa  610  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  65.3 
 
 		 461 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  65.6 
 
 		 460 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  64.25 
 
 		 480 aa  596  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  63.45 
 
 		 462 aa  584  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  65.53 
 
 		 844 aa  556  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  69.11 
 
 		 903 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  55.48 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  54.55 
 
 		 509 aa  492  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  45.79 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  46.17 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  44.55 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  45.95 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  84.21 
 
 		 749 aa  409  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  81.14 
 
 		 772 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  43.6 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  44.7 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  43.48 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  42.5 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  42.53 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  44.67 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  44.75 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  80.62 
 
 		 879 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  45.66 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.21 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.58 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  80.18 
 
 		 863 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.49 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  41.51 
 
 		 447 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  78.76 
 
 		 782 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  78.76 
 
 		 782 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  43.12 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  46.91 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  41.78 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  40.64 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.23 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 476 aa  377  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  41.78 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 476 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.01 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  42.82 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  41.01 
 
 		 509 aa  372  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.91 
 
 		 481 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  39.46 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  40.36 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  74.34 
 
 		 832 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  39.86 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.71 
 
 		 444 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.71 
 
 		 439 aa  365  1e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  42.47 
 
 		 471 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  42.47 
 
 		 471 aa  363  2e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  42.02 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 443 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  41.06 
 
 		 470 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  39.6 
 
 		 525 aa  361  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  40.18 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  41.46 
 
 		 462 aa  361  2e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  39.82 
 
 		 513 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  73.57 
 
 		 939 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 441 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  40 
 
 		 539 aa  355  6.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  42.26 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  41.12 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  39.59 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2895  DnaB domain protein helicase domain protein  44.49 
 
 		 448 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213935  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  41.81 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>