More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5366 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  64.67 
 
 
1118 aa  937    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  64.74 
 
 
749 aa  978    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  66.79 
 
 
772 aa  1031    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  100 
 
 
782 aa  1586    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  81.9 
 
 
879 aa  694    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  57.46 
 
 
832 aa  886    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  63.71 
 
 
824 aa  1012    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  100 
 
 
782 aa  1586    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  86.08 
 
 
863 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  69.82 
 
 
871 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  65.98 
 
 
865 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  75.3 
 
 
460 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  64.08 
 
 
939 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  35.37 
 
 
807 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  34.36 
 
 
821 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  35.02 
 
 
831 aa  422  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  86.61 
 
 
874 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  77.2 
 
 
459 aa  396  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  78.76 
 
 
469 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  79.57 
 
 
448 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  79.57 
 
 
464 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  78.32 
 
 
464 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  74.34 
 
 
451 aa  354  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  73.13 
 
 
454 aa  349  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  72.89 
 
 
453 aa  345  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  71.12 
 
 
460 aa  343  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  73.13 
 
 
455 aa  343  5e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  72.57 
 
 
449 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  72.89 
 
 
461 aa  342  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  71.81 
 
 
457 aa  340  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  70.48 
 
 
452 aa  337  7e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  69.47 
 
 
452 aa  334  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  68.28 
 
 
462 aa  333  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  68.72 
 
 
452 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  69.47 
 
 
468 aa  330  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  61.72 
 
 
460 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  61.57 
 
 
461 aa  327  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  67.56 
 
 
457 aa  327  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  69.91 
 
 
474 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  66.67 
 
 
480 aa  315  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  61.89 
 
 
844 aa  296  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  61.78 
 
 
481 aa  288  4e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  61.78 
 
 
509 aa  287  5e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  67.12 
 
 
903 aa  286  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
481 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.67 
 
 
444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  50.89 
 
 
445 aa  240  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  48.9 
 
 
481 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.84 
 
 
441 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  49.38 
 
 
450 aa  234  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  52.15 
 
 
449 aa  234  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.66 
 
 
442 aa  233  9e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  48.03 
 
 
449 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  48.25 
 
 
454 aa  230  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  47.73 
 
 
442 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5914  replicative DNA helicase  46.49 
 
 
453 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.11 
 
 
446 aa  228  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  42.47 
 
 
440 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  48.44 
 
 
454 aa  224  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  48.44 
 
 
454 aa  223  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47.11 
 
 
449 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.9 
 
 
447 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  47.14 
 
 
461 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  45.78 
 
 
444 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
318 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  47.11 
 
 
453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  48.9 
 
 
465 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  47.79 
 
 
448 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  47.56 
 
 
453 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.8 
 
 
449 aa  221  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  46.81 
 
 
525 aa  221  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  46.05 
 
 
470 aa  221  6e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  47.87 
 
 
456 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.23 
 
 
460 aa  220  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  47.35 
 
 
471 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  50.93 
 
 
443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.88 
 
 
444 aa  218  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  46.67 
 
 
439 aa  218  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  46.26 
 
 
471 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
459 aa  217  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  50.92 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.41 
 
 
462 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  47.01 
 
 
512 aa  216  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  46.86 
 
 
456 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  47.58 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  47.58 
 
 
460 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  48.87 
 
 
458 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  47.14 
 
 
447 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  44.93 
 
 
476 aa  213  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  48.39 
 
 
456 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  45.18 
 
 
460 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  43.61 
 
 
471 aa  213  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>