More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3033 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  55.57 
 
 		 831 aa  894    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  100 
 
 		 821 aa  1695    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  59.63 
 
 		 807 aa  973    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  96.2 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  34.02 
 
 		 824 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  35.44 
 
 		 782 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  35.44 
 
 		 782 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  70.53 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  33.87 
 
 		 863 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  89.87 
 
 		 469 aa  425  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  33.41 
 
 		 879 aa  425  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  33.17 
 
 		 832 aa  422  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  35.4 
 
 		 772 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  32.69 
 
 		 871 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  35.26 
 
 		 1118 aa  410  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  80.17 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  80.17 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  81.78 
 
 		 472 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  82.2 
 
 		 473 aa  392  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  79.91 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  32.3 
 
 		 749 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  62.33 
 
 		 471 aa  353  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  72.34 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  53.6 
 
 		 462 aa  298  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  52.96 
 
 		 473 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  53.24 
 
 		 462 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  53.05 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  55.63 
 
 		 463 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  57.34 
 
 		 463 aa  293  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  52.69 
 
 		 462 aa  292  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1400  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.94223  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2412  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1890  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  52.71 
 
 		 460 aa  292  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 460 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 460 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 460 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 460 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  52.35 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  52.33 
 
 		 461 aa  290  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  52.33 
 
 		 461 aa  290  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  54.78 
 
 		 462 aa  286  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  62.5 
 
 		 469 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0432  replicative DNA helicase  64.68 
 
 		 479 aa  282  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.789235  normal  0.752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  57.54 
 
 		 476 aa  281  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  56.92 
 
 		 460 aa  280  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  56.92 
 
 		 460 aa  280  8e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  60.53 
 
 		 465 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  56.75 
 
 		 476 aa  277  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  50.34 
 
 		 472 aa  276  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  53.08 
 
 		 462 aa  275  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  56.97 
 
 		 461 aa  273  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  55.95 
 
 		 471 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  55.95 
 
 		 471 aa  270  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  54.96 
 
 		 470 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  55.2 
 
 		 461 aa  267  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  52.82 
 
 		 470 aa  266  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  48.37 
 
 		 457 aa  264  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  48.37 
 
 		 457 aa  264  4.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  56.71 
 
 		 465 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  38.46 
 
 		 865 aa  263  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  53.85 
 
 		 464 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  53.85 
 
 		 464 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  56.28 
 
 		 465 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  56.28 
 
 		 465 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  56.28 
 
 		 465 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  52.82 
 
 		 464 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  52.42 
 
 		 464 aa  260  7e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  52.42 
 
 		 465 aa  260  7e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  52.42 
 
 		 463 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  52.42 
 
 		 464 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  53.09 
 
 		 466 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  53.09 
 
 		 466 aa  256  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0959  primary replicative DNA helicase  55.9 
 
 		 467 aa  254  3e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1459  replicative DNA helicase  55.9 
 
 		 467 aa  255  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  53.5 
 
 		 466 aa  253  8.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  56 
 
 		 472 aa  253  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  56.58 
 
 		 453 aa  252  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  56.39 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 318 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1060  primary replicative DNA helicase  54.11 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  51.59 
 
 		 849 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  54.39 
 
 		 453 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  50.82 
 
 		 447 aa  248  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  50.82 
 
 		 442 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  48.81 
 
 		 458 aa  247  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  53.51 
 
 		 449 aa  247  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  53.51 
 
 		 453 aa  247  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  41.19 
 
 		 1098 aa  247  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>