More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5558 on replicon NC_009339
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  78.77 
 
 
459 aa  704    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  75.95 
 
 
469 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  100 
 
 
464 aa  937    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  91.93 
 
 
448 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  79.04 
 
 
460 aa  723    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  90.71 
 
 
464 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  83.81 
 
 
874 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  67.89 
 
 
454 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  68.81 
 
 
452 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  66.82 
 
 
468 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  66.51 
 
 
451 aa  604  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  65.85 
 
 
457 aa  598  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  66.67 
 
 
461 aa  599  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  64.4 
 
 
460 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  67.66 
 
 
452 aa  600  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  66.67 
 
 
452 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  65.07 
 
 
455 aa  592  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  65.75 
 
 
453 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  63.68 
 
 
457 aa  587  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  65.83 
 
 
480 aa  583  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  65.07 
 
 
462 aa  578  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  65.3 
 
 
474 aa  580  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  63.7 
 
 
461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  63.84 
 
 
460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  65.07 
 
 
449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  66.32 
 
 
844 aa  524  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  67.11 
 
 
903 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  56.65 
 
 
481 aa  497  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  55.28 
 
 
509 aa  485  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  44.62 
 
 
445 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  43.15 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
449 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
442 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.57 
 
 
449 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  44.72 
 
 
444 aa  388  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.13 
 
 
448 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
449 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.34 
 
 
453 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  42.2 
 
 
447 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  44.14 
 
 
454 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  44.14 
 
 
454 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.38 
 
 
453 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
440 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.34 
 
 
446 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.18 
 
 
458 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  77.63 
 
 
749 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  41.78 
 
 
449 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  78.32 
 
 
782 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  41.78 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
441 aa  369  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  77.63 
 
 
772 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  78.32 
 
 
782 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
453 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.4 
 
 
456 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  76.65 
 
 
879 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  41.94 
 
 
445 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  76.65 
 
 
863 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  41.84 
 
 
441 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  41.2 
 
 
509 aa  365  1e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  41.15 
 
 
444 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.56 
 
 
442 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  38.94 
 
 
442 aa  359  5e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  42.2 
 
 
456 aa  358  8e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  42.28 
 
 
476 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  41.76 
 
 
456 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  42.44 
 
 
476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  41.85 
 
 
456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  41.95 
 
 
459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.57 
 
 
443 aa  355  6.999999999999999e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  40.27 
 
 
481 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  40.95 
 
 
471 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  40.95 
 
 
471 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  40.74 
 
 
444 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  40.74 
 
 
439 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  41.37 
 
 
465 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  41.06 
 
 
470 aa  351  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  41.88 
 
 
450 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  42.56 
 
 
462 aa  349  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
471 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  42.67 
 
 
473 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  41.46 
 
 
461 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  42.14 
 
 
450 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  40.55 
 
 
481 aa  347  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  39.43 
 
 
463 aa  343  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  38.67 
 
 
525 aa  343  5e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  38.8 
 
 
529 aa  342  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
460 aa  341  1e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  39.78 
 
 
456 aa  342  1e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  39.59 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
460 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  37.3 
 
 
513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  41.91 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2895  DnaB domain protein helicase domain protein  44.27 
 
 
448 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213935  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  70.48 
 
 
939 aa  336  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>