More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6265 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  100 
 
 
441 aa  884    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  51.24 
 
 
474 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  47.63 
 
 
468 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  50.8 
 
 
452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  48.12 
 
 
451 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  47.71 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  47.07 
 
 
454 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
457 aa  396  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  46.62 
 
 
460 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  47.26 
 
 
462 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
453 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  48.28 
 
 
449 aa  391  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  46.73 
 
 
459 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  47.09 
 
 
460 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  46.91 
 
 
469 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  46.8 
 
 
448 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  46.8 
 
 
464 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  46.91 
 
 
457 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  47.63 
 
 
452 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  44.62 
 
 
480 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  45.87 
 
 
461 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  46.03 
 
 
455 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  46.95 
 
 
452 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  45.77 
 
 
460 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
464 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  45.18 
 
 
844 aa  334  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  41.44 
 
 
509 aa  333  4e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  41.46 
 
 
440 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
874 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  44.53 
 
 
903 aa  318  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  41.09 
 
 
448 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  40 
 
 
446 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
442 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  38.95 
 
 
445 aa  316  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  41.78 
 
 
453 aa  316  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  41.35 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  41.04 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  37.73 
 
 
441 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  38.41 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  43.33 
 
 
508 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  40.32 
 
 
444 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  40.59 
 
 
473 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  39.53 
 
 
481 aa  306  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  41.55 
 
 
447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  39.44 
 
 
446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  41.55 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  41.04 
 
 
459 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  40.75 
 
 
445 aa  302  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  40.36 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  40.36 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  39.82 
 
 
477 aa  302  8.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  40.74 
 
 
468 aa  301  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  39.14 
 
 
447 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  41.08 
 
 
465 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  39.76 
 
 
446 aa  299  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  39.46 
 
 
472 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  40.98 
 
 
454 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  40.52 
 
 
454 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  40.33 
 
 
453 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  39.86 
 
 
449 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  38.15 
 
 
443 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  39.86 
 
 
453 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  41.07 
 
 
469 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  39.62 
 
 
453 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  39.19 
 
 
456 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  38.84 
 
 
481 aa  289  7e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  40.15 
 
 
444 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  42.35 
 
 
457 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  42.35 
 
 
457 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  40.67 
 
 
460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  40.23 
 
 
437 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  40.47 
 
 
473 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  37.74 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  38.73 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  38.42 
 
 
462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  40.43 
 
 
460 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  38.94 
 
 
444 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  40.57 
 
 
461 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  39.81 
 
 
476 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  36.21 
 
 
444 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  39.53 
 
 
456 aa  281  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  39.67 
 
 
471 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  37.87 
 
 
468 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  38.94 
 
 
441 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  39.67 
 
 
471 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  41.94 
 
 
451 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  37.59 
 
 
463 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  36.49 
 
 
439 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  37.7 
 
 
453 aa  281  2e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  39.28 
 
 
478 aa  280  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  39.34 
 
 
470 aa  279  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  37.53 
 
 
468 aa  278  9e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  37.95 
 
 
458 aa  279  9e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>