More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1149 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  71.75 
 
 
450 aa  643    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  93.69 
 
 
444 aa  847    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  100 
 
 
444 aa  897    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  62.3 
 
 
446 aa  570  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  67.01 
 
 
593 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  51.38 
 
 
442 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  49.54 
 
 
448 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.85 
 
 
445 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  51.04 
 
 
444 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  47.93 
 
 
441 aa  428  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  50.92 
 
 
442 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.8 
 
 
446 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
449 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  49.2 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  49.43 
 
 
453 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  51.37 
 
 
454 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  51.15 
 
 
454 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  49.19 
 
 
440 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  46.51 
 
 
445 aa  409  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  47.22 
 
 
447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  49.54 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.15 
 
 
459 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  48.4 
 
 
454 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  46.45 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  45.14 
 
 
444 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  45.14 
 
 
439 aa  398  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  46.77 
 
 
460 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  47.95 
 
 
472 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  46.54 
 
 
460 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  46.77 
 
 
460 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0540  replicative DNA helicase  46.89 
 
 
458 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.426524  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_481  replicative DNA helicase  46.89 
 
 
458 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  47.95 
 
 
471 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  47.95 
 
 
468 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  46.95 
 
 
444 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  46.73 
 
 
444 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0516  primary replicative DNA helicase  46.49 
 
 
458 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  50.35 
 
 
441 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
456 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  46.77 
 
 
472 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  44.02 
 
 
456 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  47.24 
 
 
471 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  46.77 
 
 
472 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  46.31 
 
 
460 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
449 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  44.19 
 
 
442 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.44 
 
 
446 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
450 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  46.77 
 
 
450 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
456 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.09 
 
 
462 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  46.56 
 
 
445 aa  380  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
466 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
466 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.96 
 
 
454 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  47.38 
 
 
456 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  45.9 
 
 
466 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
451 aa  373  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  46.45 
 
 
443 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  45.82 
 
 
451 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  45.12 
 
 
452 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  44.87 
 
 
446 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  45.12 
 
 
452 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  45.66 
 
 
443 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.82 
 
 
460 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.47 
 
 
449 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  42.82 
 
 
455 aa  369  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  44.02 
 
 
449 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  46.56 
 
 
470 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  46.5 
 
 
450 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  41.84 
 
 
460 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  43.39 
 
 
461 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.92 
 
 
456 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  41.76 
 
 
453 aa  366  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 
513 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  45.16 
 
 
453 aa  367  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  43.29 
 
 
460 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.52 
 
 
458 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  42 
 
 
451 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  44.64 
 
 
463 aa  364  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  42.24 
 
 
457 aa  364  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  46.4 
 
 
437 aa  363  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.75 
 
 
452 aa  364  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  44.14 
 
 
508 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  42.46 
 
 
480 aa  363  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
481 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  42.79 
 
 
449 aa  362  6e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  42.17 
 
 
468 aa  362  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  42.48 
 
 
522 aa  361  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.54 
 
 
456 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  46.77 
 
 
471 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  46.77 
 
 
471 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  46.77 
 
 
471 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>