More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3990 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  100 
 
 		 444 aa  896    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  93.69 
 
 		 444 aa  847    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  71.07 
 
 		 450 aa  631  1e-180  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  62.39 
 
 		 446 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  64.68 
 
 		 593 aa  511  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  50.69 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.26 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.39 
 
 		 445 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.16 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  51.28 
 
 		 444 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  47.94 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  48.27 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  47.61 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  50 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47.72 
 
 		 449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  50.23 
 
 		 454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  47.84 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  47.93 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  48.16 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.53 
 
 		 447 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  48.98 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  48.75 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  48.63 
 
 		 454 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  47.7 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.35 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  48.3 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  48.3 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  48.98 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  48.16 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  47.7 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  46.35 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  45.77 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.4 
 
 		 453 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  46.58 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  45.64 
 
 		 450 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  46.06 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0540  replicative DNA helicase  46.89 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.426524  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 456 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.75 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.75 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0516  primary replicative DNA helicase  46.71 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_481  replicative DNA helicase  46.67 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  49.42 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  44.5 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  44.34 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  47 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  45.12 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  44.59 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  45.75 
 
 		 446 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  42.36 
 
 		 455 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  44.19 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  43.26 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  46.01 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.98 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.03 
 
 		 454 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.12 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.35 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  44.57 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  41.76 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  43.16 
 
 		 461 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  44.75 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  43.06 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  44.57 
 
 		 466 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.49 
 
 		 458 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  42.4 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  43.14 
 
 		 522 aa  365  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  44.6 
 
 		 508 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  45.77 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  43.64 
 
 		 481 aa  363  3e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  41.07 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  42 
 
 		 451 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.55 
 
 		 457 aa  362  1e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  40.92 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  41.67 
 
 		 480 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.47 
 
 		 456 aa  361  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  44.95 
 
 		 445 aa  360  2e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  43.37 
 
 		 529 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  45.12 
 
 		 525 aa  361  2e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  46.05 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  42.59 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 471 aa  359  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  46.77 
 
 		 471 aa  359  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>