More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_5064 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  52.34 
 
 
874 aa  887    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  96.4 
 
 
468 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  57.8 
 
 
1118 aa  659    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  100 
 
 
844 aa  1700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  58.51 
 
 
903 aa  975    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  79.9 
 
 
474 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  67.68 
 
 
459 aa  560  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  65.53 
 
 
469 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  67 
 
 
460 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  66.75 
 
 
453 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  68.64 
 
 
452 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  66.75 
 
 
461 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  64.71 
 
 
451 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  62.35 
 
 
454 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  65.75 
 
 
452 aa  537  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  64.03 
 
 
460 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  65.47 
 
 
457 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  67.1 
 
 
448 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  64.51 
 
 
464 aa  526  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  64 
 
 
452 aa  525  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  66.32 
 
 
464 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  60.39 
 
 
449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  36.5 
 
 
879 aa  516  1.0000000000000001e-145  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  62.05 
 
 
457 aa  508  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  36.84 
 
 
945 aa  505  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  60 
 
 
460 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  60.61 
 
 
455 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  58.06 
 
 
461 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  60.41 
 
 
480 aa  488  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  59.17 
 
 
462 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  52.55 
 
 
481 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  51.36 
 
 
509 aa  423  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  37.37 
 
 
1272 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  35.92 
 
 
1381 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  46.7 
 
 
446 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.07 
 
 
445 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.57 
 
 
449 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.31 
 
 
449 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.85 
 
 
448 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
449 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  46.55 
 
 
454 aa  363  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  40.95 
 
 
610 aa  362  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  44.64 
 
 
442 aa  362  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.53 
 
 
453 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.8 
 
 
456 aa  360  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  39.71 
 
 
585 aa  360  8e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  40.76 
 
 
610 aa  360  9e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  46.55 
 
 
454 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  47.06 
 
 
456 aa  356  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  45.78 
 
 
440 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.55 
 
 
444 aa  354  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
446 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  45.27 
 
 
453 aa  353  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
453 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.78 
 
 
458 aa  353  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.5 
 
 
453 aa  352  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.5 
 
 
449 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.18 
 
 
456 aa  351  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.92 
 
 
444 aa  351  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
445 aa  351  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  43.15 
 
 
447 aa  351  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  42.67 
 
 
444 aa  350  7e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
459 aa  349  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  42.67 
 
 
439 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.41 
 
 
481 aa  346  1e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  38.93 
 
 
602 aa  341  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  38.11 
 
 
593 aa  340  7e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.25 
 
 
456 aa  340  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  43.18 
 
 
453 aa  340  9e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.62 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  42.2 
 
 
441 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  41.94 
 
 
442 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  43.73 
 
 
451 aa  334  5e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  43.52 
 
 
471 aa  333  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  43.11 
 
 
509 aa  330  7e-89  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
457 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  44.76 
 
 
457 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  42.64 
 
 
456 aa  328  2.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  41.45 
 
 
529 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  45.18 
 
 
441 aa  327  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  40.77 
 
 
443 aa  327  7e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  40.4 
 
 
463 aa  325  2e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  41.96 
 
 
462 aa  323  7e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.62 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  40.61 
 
 
513 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  41.94 
 
 
476 aa  321  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  40.62 
 
 
481 aa  319  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  39.76 
 
 
539 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.83 
 
 
443 aa  319  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  40.97 
 
 
525 aa  318  2e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  41.77 
 
 
457 aa  318  3e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  43.11 
 
 
508 aa  317  5e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  41.71 
 
 
444 aa  317  7e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  41.18 
 
 
476 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>