More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3756 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  100 
 
 		 442 aa  902    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  55.66 
 
 		 445 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  55.08 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  54.48 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  51.14 
 
 		 440 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  51.47 
 
 		 454 aa  471  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  50.92 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  51.69 
 
 		 454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  51.49 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  50.8 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  51.49 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  51.04 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  48.31 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  49.77 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  48.31 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  49.65 
 
 		 447 aa  458  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 453 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.91 
 
 		 442 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  46.68 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  47.26 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  48.74 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  48.44 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  47.14 
 
 		 476 aa  421  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  46.79 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  46.58 
 
 		 481 aa  421  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  48.88 
 
 		 456 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  48.31 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  46.79 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  48.53 
 
 		 449 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  45.97 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  47.79 
 
 		 458 aa  421  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  45.97 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  45.75 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  47.48 
 
 		 456 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.09 
 
 		 449 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.33 
 
 		 446 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  48.45 
 
 		 473 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.28 
 
 		 453 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  45.77 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  45.77 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  43.72 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  47.37 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  46.45 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  45.8 
 
 		 508 aa  412  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  45.31 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  43.72 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.82 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  46.47 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  47.29 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 461 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  43.61 
 
 		 454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.31 
 
 		 460 aa  406  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  44.16 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  46.47 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  46.74 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  41.82 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  46.47 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  46.47 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.5 
 
 		 462 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  45.83 
 
 		 450 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  45.33 
 
 		 462 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  43.48 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  43.94 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  42.51 
 
 		 460 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  43.25 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  46.7 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.09 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  45.1 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  43.48 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  45.45 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  42.17 
 
 		 457 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  45.33 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  41.9 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 468 aa  398  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  45.68 
 
 		 477 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  44.98 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  46.24 
 
 		 460 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  41.06 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  46.12 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  45.6 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  45.75 
 
 		 447 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1404  replicative DNA helicase  46.01 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  45.23 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  46.47 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>