More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3095 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  100 
 
 
446 aa  906    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  70.72 
 
 
437 aa  628  1e-179  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  78.73 
 
 
879 aa  610  1e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  53.05 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  53.56 
 
 
448 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  49.21 
 
 
445 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  52.05 
 
 
453 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.75 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
453 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  50 
 
 
449 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  50.45 
 
 
453 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.98 
 
 
441 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  49.66 
 
 
444 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.32 
 
 
444 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  50.34 
 
 
459 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  51.14 
 
 
454 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.53 
 
 
449 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  50.79 
 
 
465 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.09 
 
 
449 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  50 
 
 
454 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.78 
 
 
456 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  49.54 
 
 
446 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  48.07 
 
 
442 aa  419  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  49.1 
 
 
462 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  47.18 
 
 
449 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.23 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.67 
 
 
463 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  46.82 
 
 
442 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  47.45 
 
 
466 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  47.45 
 
 
466 aa  410  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
456 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  47.15 
 
 
447 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  48.76 
 
 
461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  48.99 
 
 
472 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
456 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  46.94 
 
 
481 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  46.12 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  47.19 
 
 
461 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  48.21 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  46.31 
 
 
476 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  45.86 
 
 
476 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  47.97 
 
 
471 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.93 
 
 
444 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.93 
 
 
439 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  47.18 
 
 
473 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  46.5 
 
 
469 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  47.84 
 
 
441 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  47.42 
 
 
463 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  46.95 
 
 
472 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
453 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  46.07 
 
 
462 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  45.7 
 
 
464 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.84 
 
 
458 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  47.44 
 
 
468 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  47.44 
 
 
451 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  47.44 
 
 
468 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  48.41 
 
 
450 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  47.07 
 
 
468 aa  389  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  46.97 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  48.42 
 
 
473 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  46.74 
 
 
443 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
467 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  48.55 
 
 
468 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  48.54 
 
 
462 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  45.72 
 
 
472 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
471 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  44.8 
 
 
464 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
470 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
464 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
468 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  46.38 
 
 
447 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
461 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  47.18 
 
 
450 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  46.14 
 
 
454 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
461 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  47.19 
 
 
463 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
463 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  45.09 
 
 
513 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  46.52 
 
 
468 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  44.8 
 
 
464 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  48.11 
 
 
468 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  45.62 
 
 
470 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
464 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  46.97 
 
 
471 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  46.44 
 
 
444 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>