More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1232 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  100 
 
 
509 aa  1047    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  83.26 
 
 
481 aa  817    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  60.91 
 
 
457 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  58.61 
 
 
453 aa  535  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  58.54 
 
 
461 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  58.33 
 
 
455 aa  525  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  56.26 
 
 
454 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  57.27 
 
 
460 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  57.44 
 
 
461 aa  513  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  56.18 
 
 
457 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  55.14 
 
 
459 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  57.11 
 
 
462 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  55.9 
 
 
480 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  56.59 
 
 
451 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  56.04 
 
 
452 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  56.98 
 
 
449 aa  498  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  55.02 
 
 
460 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  54.28 
 
 
460 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  53.52 
 
 
468 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  54.55 
 
 
469 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  54.36 
 
 
448 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  55.25 
 
 
452 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  54.36 
 
 
464 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  55.28 
 
 
464 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  52.32 
 
 
474 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  53.24 
 
 
452 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  55.24 
 
 
903 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  54.31 
 
 
874 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  51.36 
 
 
844 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.41 
 
 
445 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
442 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.05 
 
 
449 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  42.82 
 
 
449 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  42.24 
 
 
446 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
456 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.21 
 
 
441 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  42.73 
 
 
449 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  42.69 
 
 
447 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  42.57 
 
 
448 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
440 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  42.48 
 
 
456 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
453 aa  365  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.71 
 
 
459 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
458 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  40.64 
 
 
539 aa  361  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  41.96 
 
 
456 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  42.24 
 
 
444 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
449 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  41.7 
 
 
481 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  41.95 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
453 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.57 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
471 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  41.95 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  42.73 
 
 
453 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
453 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  41.65 
 
 
470 aa  355  7.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  42.83 
 
 
456 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  41.4 
 
 
529 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
446 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.05 
 
 
454 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  40.76 
 
 
513 aa  352  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  41.45 
 
 
469 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  42.35 
 
 
454 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
447 aa  349  6e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  40.53 
 
 
462 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  42.51 
 
 
450 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  40.65 
 
 
444 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  40.65 
 
 
439 aa  345  2e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  39.41 
 
 
442 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.32 
 
 
481 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
444 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  40.45 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  40.51 
 
 
525 aa  340  5e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  40.45 
 
 
509 aa  339  5.9999999999999996e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  40.18 
 
 
451 aa  338  9e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  40.18 
 
 
451 aa  338  9e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  43.08 
 
 
444 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  40.4 
 
 
528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.57 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  39.79 
 
 
522 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  40.35 
 
 
508 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  39.73 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
444 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  40.09 
 
 
465 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  41.36 
 
 
472 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  40.36 
 
 
473 aa  335  9e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  41.14 
 
 
468 aa  335  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  41.8 
 
 
463 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  39.91 
 
 
472 aa  334  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  40.27 
 
 
514 aa  333  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  40.45 
 
 
472 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>