More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1242 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  100 
 
 		 528 aa  1078    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  57.37 
 
 		 525 aa  527  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  54.31 
 
 		 539 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  53.09 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  53.79 
 
 		 529 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  55.13 
 
 		 522 aa  502  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  55.56 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  50.1 
 
 		 513 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  53.02 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  51.19 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.09 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  45.88 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.74 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.74 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  41.79 
 
 		 510 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  44.24 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  42.86 
 
 		 507 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  43.21 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  43.12 
 
 		 441 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  43.37 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  41.12 
 
 		 511 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  42.12 
 
 		 511 aa  374  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  43.92 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  44.72 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  43.92 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  42.53 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.43 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  40.4 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.21 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.37 
 
 		 459 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  44.34 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  41.7 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  48.21 
 
 		 945 aa  365  1e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 516 aa  364  2e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  41.93 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  44.67 
 
 		 454 aa  363  4e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  42.25 
 
 		 507 aa  363  6e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  41.03 
 
 		 456 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.41 
 
 		 444 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  40.61 
 
 		 456 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.12 
 
 		 461 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  43.24 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  40.53 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  41.82 
 
 		 445 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  40.65 
 
 		 458 aa  356  5.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  38.93 
 
 		 460 aa  354  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  43.47 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  43.24 
 
 		 460 aa  352  8e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  43.02 
 
 		 460 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  43.89 
 
 		 471 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  39.32 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  42.57 
 
 		 460 aa  350  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  43.24 
 
 		 450 aa  350  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  40.63 
 
 		 444 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  40.63 
 
 		 439 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  43.5 
 
 		 526 aa  349  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  39.64 
 
 		 454 aa  349  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.37 
 
 		 471 aa  349  8e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  41.44 
 
 		 461 aa  348  1e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  41.52 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  38 
 
 		 453 aa  348  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  43.85 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  43.56 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  43.08 
 
 		 472 aa  347  4e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  40.81 
 
 		 465 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 451 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  43.86 
 
 		 444 aa  346  7e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  40.93 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  39.44 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  40.44 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  40.9 
 
 		 469 aa  345  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  39.29 
 
 		 455 aa  344  2.9999999999999997e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  41.35 
 
 		 472 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  43.12 
 
 		 450 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  41.24 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  44.54 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  39.02 
 
 		 468 aa  343  5.999999999999999e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  39.02 
 
 		 468 aa  343  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  40.22 
 
 		 468 aa  342  8e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  39.56 
 
 		 451 aa  342  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 450 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  40.67 
 
 		 473 aa  340  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  40.49 
 
 		 463 aa  339  8e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 473 aa  339  8e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  37.01 
 
 		 457 aa  339  8e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  41.52 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  40.98 
 
 		 456 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>