More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0342 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  82.94 
 
 		 507 aa  868    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  71.54 
 
 		 526 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  80.91 
 
 		 511 aa  833    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  81.64 
 
 		 511 aa  855    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  84.9 
 
 		 507 aa  882    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  75.64 
 
 		 516 aa  756    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  100 
 
 		 510 aa  1043    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  42.91 
 
 		 529 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  42.48 
 
 		 513 aa  415  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  44.47 
 
 		 509 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  42.28 
 
 		 522 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  44.28 
 
 		 525 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  41.62 
 
 		 539 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  46.99 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.19 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  45.45 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  45.96 
 
 		 454 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  44.64 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  44.2 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  42.4 
 
 		 528 aa  388  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  46.38 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  40.52 
 
 		 512 aa  388  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.17 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  42.53 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 449 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  43.65 
 
 		 514 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.3 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  42.27 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  41.99 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  42.21 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  47.94 
 
 		 945 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  42.05 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  43.57 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  43.18 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.47 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.97 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.88 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.88 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.54 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  42.11 
 
 		 448 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.96 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.44 
 
 		 453 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  43.04 
 
 		 461 aa  363  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  43.3 
 
 		 471 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  43.83 
 
 		 468 aa  360  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  42.36 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  41.7 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  42.27 
 
 		 444 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 468 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  44 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  42.14 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  42.14 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  41.68 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  41.92 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  41.96 
 
 		 464 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 465 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  43.04 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  43.04 
 
 		 468 aa  353  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  41.48 
 
 		 465 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  41.69 
 
 		 446 aa  352  8e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  41.14 
 
 		 464 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  42.13 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  41.74 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  42.13 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  41.14 
 
 		 464 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 451 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  42.13 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  42.13 
 
 		 468 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  41.63 
 
 		 442 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.37 
 
 		 456 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  350  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  43.76 
 
 		 471 aa  350  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  43.97 
 
 		 468 aa  349  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  42.61 
 
 		 470 aa  349  7e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  41.52 
 
 		 508 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 468 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  40.45 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  40.45 
 
 		 460 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  40.7 
 
 		 464 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  43.1 
 
 		 474 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>