More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0364 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  100 
 
 		 526 aa  1068    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  71.46 
 
 		 511 aa  750    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  73.23 
 
 		 511 aa  788    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  81.37 
 
 		 516 aa  823    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  72.45 
 
 		 507 aa  778    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  73.85 
 
 		 507 aa  788    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  71.54 
 
 		 510 aa  763    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  43.97 
 
 		 539 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  45.73 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  45.67 
 
 		 513 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  42.16 
 
 		 522 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  43.18 
 
 		 509 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  42.41 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  42.48 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  47.06 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  45.93 
 
 		 454 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  44.4 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  45.07 
 
 		 454 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  44.69 
 
 		 524 aa  381  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.84 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.7 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  41.87 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  43.5 
 
 		 528 aa  370  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 481 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.15 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  41.96 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  43.65 
 
 		 456 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  44.37 
 
 		 449 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.08 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  43.18 
 
 		 456 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  46.68 
 
 		 945 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 456 aa  362  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  43.5 
 
 		 444 aa  360  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.64 
 
 		 449 aa  360  5e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 445 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.38 
 
 		 481 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 444 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.47 
 
 		 453 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  42.18 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  44.47 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  42.18 
 
 		 460 aa  353  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  43.02 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  41.53 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.33 
 
 		 456 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.35 
 
 		 471 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  41.48 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  43.21 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  42.41 
 
 		 461 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  43.07 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  43.07 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  43.07 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  43.07 
 
 		 468 aa  347  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  43.07 
 
 		 468 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  41.63 
 
 		 478 aa  345  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  45 
 
 		 450 aa  345  2e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  41.76 
 
 		 464 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  43.16 
 
 		 471 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  42.7 
 
 		 468 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  42.95 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  41.23 
 
 		 446 aa  342  8e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  342  8e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  44.77 
 
 		 451 aa  342  9e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.63 
 
 		 442 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  43.92 
 
 		 456 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  41.53 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  41.53 
 
 		 464 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  41.7 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 471 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  41.7 
 
 		 465 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  41.76 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  41.53 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  41.08 
 
 		 465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  39.14 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.27 
 
 		 461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  41.48 
 
 		 465 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  40.36 
 
 		 454 aa  339  7e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  41.68 
 
 		 468 aa  339  7e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  41.77 
 
 		 468 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  41.77 
 
 		 468 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  41.77 
 
 		 468 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  41.77 
 
 		 468 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  41.88 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>