More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4223 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  100 
 
 
456 aa  925    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.18 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  49.45 
 
 
456 aa  408  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  48.54 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  48.21 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.38 
 
 
444 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  46.38 
 
 
439 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  48.42 
 
 
460 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.31 
 
 
449 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  47.19 
 
 
453 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  48.12 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  47.51 
 
 
447 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  48.08 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  46.95 
 
 
448 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.88 
 
 
445 aa  398  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  46.86 
 
 
446 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.78 
 
 
445 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
453 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
441 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  45.17 
 
 
449 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  45.17 
 
 
453 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  47.07 
 
 
444 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
449 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.78 
 
 
456 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  45.23 
 
 
449 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
442 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.65 
 
 
481 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  47.38 
 
 
444 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  46.36 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  46.36 
 
 
468 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  46.36 
 
 
468 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  45.91 
 
 
460 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  45.91 
 
 
460 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  46.19 
 
 
459 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  46.36 
 
 
470 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  46.36 
 
 
451 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  46.74 
 
 
450 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  44.08 
 
 
529 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  46.01 
 
 
444 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
471 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  46.26 
 
 
473 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  47.02 
 
 
472 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  46.03 
 
 
472 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  46.82 
 
 
441 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  45.11 
 
 
469 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  45.91 
 
 
467 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  46.59 
 
 
468 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.35 
 
 
456 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45 
 
 
462 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
462 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
442 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  46.59 
 
 
468 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  43.4 
 
 
470 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  46.61 
 
 
472 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  46.07 
 
 
451 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  47.02 
 
 
472 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.29 
 
 
446 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  46.15 
 
 
473 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  45.91 
 
 
468 aa  363  3e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  44.47 
 
 
456 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
446 aa  363  4e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  44.34 
 
 
446 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  45.96 
 
 
472 aa  363  5.0000000000000005e-99  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  42.09 
 
 
453 aa  362  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
458 aa  362  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  45.62 
 
 
469 aa  362  9e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  44.12 
 
 
513 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
471 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  43.42 
 
 
466 aa  361  2e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  45.89 
 
 
461 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
471 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
471 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
471 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
471 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
471 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
465 aa  360  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  46.09 
 
 
455 aa  360  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  45.68 
 
 
474 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  44.15 
 
 
463 aa  359  5e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  44.32 
 
 
464 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  44.9 
 
 
468 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  44.32 
 
 
464 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
461 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  42.86 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>