More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0790 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  100 
 
 
455 aa  917    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  65.78 
 
 
453 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  67.56 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  61.37 
 
 
463 aa  554  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  57.27 
 
 
443 aa  524  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  56.44 
 
 
453 aa  504  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  55.56 
 
 
449 aa  499  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  55.56 
 
 
453 aa  499  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  56 
 
 
453 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  57.92 
 
 
457 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  54.67 
 
 
454 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  54.95 
 
 
454 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  51.55 
 
 
459 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  52.48 
 
 
445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  50.43 
 
 
466 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  50.43 
 
 
466 aa  442  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  51.43 
 
 
466 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50.56 
 
 
446 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  50.56 
 
 
448 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  50 
 
 
442 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  47.98 
 
 
440 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  48.65 
 
 
447 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  45.32 
 
 
456 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  47.86 
 
 
444 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  46.19 
 
 
441 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1965  primary replicative DNA helicase  46.2 
 
 
487 aa  415  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  46.41 
 
 
461 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  47.23 
 
 
444 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  44.74 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  45.05 
 
 
449 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.19 
 
 
442 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  45.27 
 
 
449 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.71 
 
 
444 aa  394  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
439 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  44.18 
 
 
449 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.87 
 
 
462 aa  390  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  44.05 
 
 
462 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  43.52 
 
 
447 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.05 
 
 
465 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
476 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
458 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  42.92 
 
 
473 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  59.81 
 
 
318 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  44.3 
 
 
447 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  44.49 
 
 
456 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  42.64 
 
 
477 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  43.14 
 
 
442 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  43.85 
 
 
465 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  44.07 
 
 
465 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  42.63 
 
 
456 aa  377  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  43.24 
 
 
464 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.32 
 
 
476 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  43.61 
 
 
469 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  43.24 
 
 
464 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  43.85 
 
 
465 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  42.92 
 
 
469 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  43.18 
 
 
464 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  42.17 
 
 
472 aa  374  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  42.48 
 
 
472 aa  372  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.37 
 
 
446 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.47 
 
 
481 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  45.39 
 
 
446 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  44.3 
 
 
471 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  42.28 
 
 
458 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  43.18 
 
 
465 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  44.23 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  44.3 
 
 
471 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
453 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.79 
 
 
461 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  42.48 
 
 
472 aa  372  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  42.51 
 
 
464 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  42.28 
 
 
464 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
465 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  41.83 
 
 
481 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  46.09 
 
 
456 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  42.02 
 
 
445 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  43.76 
 
 
460 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
463 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  43.93 
 
 
456 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  43.33 
 
 
472 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  42.89 
 
 
460 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  42.89 
 
 
460 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  41.29 
 
 
449 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  43.92 
 
 
456 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  42.19 
 
 
468 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  41.76 
 
 
460 aa  365  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>