More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0013 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  100 
 
 		 457 aa  929    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  60.61 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  57.47 
 
 		 453 aa  514  1e-144  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0790  primary replicative DNA helicase  60.18 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  56.56 
 
 		 451 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  55.1 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  55.1 
 
 		 454 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  54.5 
 
 		 453 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  52.37 
 
 		 443 aa  478  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  53.83 
 
 		 453 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  53.38 
 
 		 453 aa  475  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  53.38 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  50.54 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  50.97 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  50.97 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  50.22 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  47.22 
 
 		 444 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  48.66 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  46.83 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.86 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  49.44 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  46.85 
 
 		 446 aa  415  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  45.76 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.43 
 
 		 456 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1965  primary replicative DNA helicase  45.2 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  46.85 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.07 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  46.83 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.02 
 
 		 442 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.58 
 
 		 447 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.98 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.62 
 
 		 465 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  43.24 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  45.5 
 
 		 449 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.72 
 
 		 456 aa  388  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  44.59 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  45.29 
 
 		 458 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.53 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44.12 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 473 aa  381  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  43.31 
 
 		 445 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  44.67 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  45.13 
 
 		 469 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.02 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  43.02 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  44.97 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  45.11 
 
 		 450 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  45.07 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  43.98 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  44.97 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  45.09 
 
 		 443 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 472 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  44.49 
 
 		 463 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  43.53 
 
 		 477 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  44.17 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.53 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  42.15 
 
 		 460 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  42.15 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.99 
 
 		 481 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 465 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  43.82 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 464 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  43.24 
 
 		 462 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  44.62 
 
 		 464 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45 
 
 		 460 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>