More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0667 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  100 
 
 
446 aa  904    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  67.72 
 
 
445 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  60.53 
 
 
451 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  60.53 
 
 
451 aa  554  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  57.3 
 
 
456 aa  512  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  47.37 
 
 
448 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  47.99 
 
 
459 aa  423  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  48.76 
 
 
456 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  46.73 
 
 
444 aa  408  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.93 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.03 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  47.24 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  47.11 
 
 
456 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
453 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.85 
 
 
442 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  48.29 
 
 
446 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  46.19 
 
 
441 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  47 
 
 
453 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.27 
 
 
445 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.7 
 
 
454 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.9 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  45.75 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.62 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  47.11 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  45.98 
 
 
449 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  45.98 
 
 
481 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  46.21 
 
 
444 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  43.7 
 
 
466 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  43.7 
 
 
466 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.4 
 
 
460 aa  390  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  45.1 
 
 
447 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  45.41 
 
 
454 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2007  replicative DNA helicase  49.21 
 
 
458 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  43.04 
 
 
466 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
457 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
457 aa  382  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.91 
 
 
481 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  45.08 
 
 
508 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  45.85 
 
 
447 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  45.78 
 
 
462 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  47.75 
 
 
451 aa  382  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  47.03 
 
 
441 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
476 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.89 
 
 
456 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.37 
 
 
456 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  47.95 
 
 
450 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  43.72 
 
 
471 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  42.83 
 
 
444 aa  375  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4640  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
471 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.215125 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  45.27 
 
 
442 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4503  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
471 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
471 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
467 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  46.59 
 
 
456 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  43.18 
 
 
462 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4494  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
471 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.0705585 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
439 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4588  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
471 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4589  replicative DNA helicase  45.25 
 
 
471 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.481251  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  44.87 
 
 
444 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  45.02 
 
 
471 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.76 
 
 
465 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
446 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  42.66 
 
 
476 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  46.22 
 
 
450 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  42.24 
 
 
452 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  43.51 
 
 
452 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  44.8 
 
 
468 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  44.19 
 
 
444 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.27 
 
 
445 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  42.73 
 
 
452 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.97 
 
 
458 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0256  replicative DNA helicase  44.57 
 
 
470 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.663248  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  44.22 
 
 
465 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3636  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
468 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  45.7 
 
 
478 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3498  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
468 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  44.27 
 
 
466 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
468 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  43.76 
 
 
463 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
468 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
468 aa  365  1e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
451 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  44.34 
 
 
468 aa  364  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  44.92 
 
 
465 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>