More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0517 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  100 
 
 
445 aa  902    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  67.72 
 
 
446 aa  621  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  61.37 
 
 
451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  61.37 
 
 
451 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0972  replicative DNA helicase  56.25 
 
 
456 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  50.11 
 
 
459 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  50.45 
 
 
448 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.98 
 
 
446 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.39 
 
 
442 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  49.21 
 
 
454 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  49.89 
 
 
454 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  47.02 
 
 
441 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.63 
 
 
449 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47.96 
 
 
449 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.95 
 
 
445 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  47.96 
 
 
453 aa  410  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  45.91 
 
 
481 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  48.19 
 
 
453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  47.87 
 
 
453 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.47 
 
 
442 aa  409  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  47.38 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  47.72 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.03 
 
 
449 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.67 
 
 
456 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.71 
 
 
453 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  46.8 
 
 
449 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.77 
 
 
444 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  47.33 
 
 
456 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  45.15 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  45.45 
 
 
469 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  45.2 
 
 
466 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  45.2 
 
 
466 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.68 
 
 
446 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  48.16 
 
 
460 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  46.94 
 
 
451 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.48 
 
 
444 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  46.56 
 
 
444 aa  389  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.2 
 
 
466 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  46.62 
 
 
454 aa  385  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  43.47 
 
 
444 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  43.69 
 
 
439 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  46.14 
 
 
472 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  45.86 
 
 
471 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.47 
 
 
481 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  46.29 
 
 
441 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  44.07 
 
 
476 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44.59 
 
 
462 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  43.96 
 
 
465 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  43.85 
 
 
476 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  45.35 
 
 
466 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  41.89 
 
 
454 aa  380  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.48 
 
 
456 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  44.67 
 
 
456 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  46.24 
 
 
445 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.37 
 
 
458 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  45.68 
 
 
443 aa  378  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  45.84 
 
 
509 aa  375  1e-103  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  44.98 
 
 
470 aa  376  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  45.12 
 
 
465 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  45 
 
 
450 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  43.89 
 
 
457 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  44.95 
 
 
444 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  46.07 
 
 
443 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44 
 
 
469 aa  376  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  40.22 
 
 
460 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  43.89 
 
 
457 aa  378  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  43.4 
 
 
471 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  44.67 
 
 
468 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  43.34 
 
 
452 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  43.4 
 
 
471 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  44.67 
 
 
468 aa  373  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  45.17 
 
 
513 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
477 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  43.6 
 
 
447 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  44.67 
 
 
451 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  44.62 
 
 
472 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  42.79 
 
 
473 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.26 
 
 
457 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  43.82 
 
 
472 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  43.24 
 
 
472 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.92 
 
 
456 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
461 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
468 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  44.44 
 
 
467 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  45.62 
 
 
471 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  41.76 
 
 
452 aa  368  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  42.21 
 
 
452 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
468 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  45 
 
 
471 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>