More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1693 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1693  replicative DNA helicase  100 
 
 
470 aa  934    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0129  replicative DNA helicase  47.63 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000444194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  47.12 
 
 
456 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  48.2 
 
 
449 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  43.88 
 
 
444 aa  398  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  48.2 
 
 
449 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.62 
 
 
441 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
481 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  46.95 
 
 
451 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  46.95 
 
 
451 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  47.09 
 
 
449 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  45.08 
 
 
447 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  44.04 
 
 
445 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  43.48 
 
 
452 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
442 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  44.4 
 
 
456 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.02 
 
 
456 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  43.32 
 
 
440 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  42.99 
 
 
443 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  43.51 
 
 
460 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.81 
 
 
458 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.55 
 
 
445 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.34 
 
 
444 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  42.26 
 
 
453 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  42.89 
 
 
446 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  43.85 
 
 
448 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  41.24 
 
 
454 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  43.09 
 
 
442 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  42.56 
 
 
457 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  41.01 
 
 
480 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.64 
 
 
456 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  43.61 
 
 
453 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  42.79 
 
 
459 aa  368  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
481 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
452 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  41.8 
 
 
449 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  41.74 
 
 
462 aa  365  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  44.14 
 
 
469 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4223  primary replicative DNA helicase  43.4 
 
 
456 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.838486  normal  0.367922 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  41.38 
 
 
455 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  40.88 
 
 
460 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  44.75 
 
 
445 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  41.96 
 
 
456 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  42.53 
 
 
452 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  40.74 
 
 
461 aa  364  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  41.06 
 
 
469 aa  363  4e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  44.02 
 
 
446 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  43.02 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  41.9 
 
 
450 aa  362  6e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  41.57 
 
 
461 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
449 aa  362  9e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  361  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  42.76 
 
 
471 aa  362  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
454 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  43.61 
 
 
468 aa  361  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.25 
 
 
453 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.79 
 
 
461 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  43.41 
 
 
444 aa  359  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  41.78 
 
 
468 aa  359  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  44.29 
 
 
446 aa  358  9e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  44.95 
 
 
454 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  40.96 
 
 
459 aa  358  9e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  40.32 
 
 
457 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  40.83 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  40.83 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  42.37 
 
 
469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2134  replicative DNA helicase  45.89 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149646  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  39.28 
 
 
508 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  42.24 
 
 
481 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  39.08 
 
 
460 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  41.65 
 
 
509 aa  356  5.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  43.12 
 
 
453 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
465 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  39.4 
 
 
451 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  41.95 
 
 
442 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  43.97 
 
 
469 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0892  replicative DNA helicase  41.44 
 
 
462 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  41.67 
 
 
451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  43.27 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5225  replicative DNA helicase  42.99 
 
 
477 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  42.06 
 
 
476 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  42.01 
 
 
474 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  42.6 
 
 
473 aa  351  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  41.44 
 
 
444 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  42.43 
 
 
450 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  42.27 
 
 
476 aa  351  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  41.06 
 
 
464 aa  350  3e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  41.44 
 
 
439 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  40.77 
 
 
446 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  41.36 
 
 
471 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  41.36 
 
 
471 aa  348  1e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  42.21 
 
 
472 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>