More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0015 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  56 
 
 		 1272 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  55.3 
 
 		 879 aa  939    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  41.89 
 
 		 903 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  100 
 
 		 945 aa  1922    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  38.8 
 
 		 874 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  36.51 
 
 		 844 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 1381 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  55.28 
 
 		 529 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  47 
 
 		 602 aa  432  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  53.32 
 
 		 509 aa  429  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  51.48 
 
 		 539 aa  416  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  49.17 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  46.65 
 
 		 593 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  50.25 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  48.61 
 
 		 514 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  51.41 
 
 		 449 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  51.27 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  51.92 
 
 		 456 aa  399  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  52.7 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  49.62 
 
 		 525 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  50 
 
 		 446 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  52.43 
 
 		 453 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  47.41 
 
 		 512 aa  391  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  52.96 
 
 		 454 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  51.91 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  50 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  50 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  52.94 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  49.12 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  51.15 
 
 		 448 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  47.94 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  49.11 
 
 		 511 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  49.23 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.57 
 
 		 449 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  48.35 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.45 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  48.73 
 
 		 507 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.31 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  51.02 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.74 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  43.39 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  48.21 
 
 		 528 aa  365  3e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  43.18 
 
 		 610 aa  364  5.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  49.37 
 
 		 445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  48.47 
 
 		 442 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  48.34 
 
 		 456 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  46.65 
 
 		 444 aa  359  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  47.26 
 
 		 439 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  51.66 
 
 		 442 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  49.36 
 
 		 459 aa  357  7.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  47.1 
 
 		 516 aa  355  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  50.64 
 
 		 444 aa  355  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  48.71 
 
 		 481 aa  351  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.82 
 
 		 466 aa  346  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  45.08 
 
 		 466 aa  346  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  45.08 
 
 		 466 aa  346  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  45.22 
 
 		 481 aa  343  8e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  47.95 
 
 		 476 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  45.41 
 
 		 454 aa  343  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  34.88 
 
 		 1118 aa  340  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  47.06 
 
 		 446 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  49.62 
 
 		 452 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  48.58 
 
 		 447 aa  340  7e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  50 
 
 		 447 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  47.58 
 
 		 471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  41.81 
 
 		 585 aa  338  3.9999999999999995e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  46.68 
 
 		 526 aa  338  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  47.29 
 
 		 476 aa  336  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 460 aa  336  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  44.59 
 
 		 461 aa  335  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  47.67 
 
 		 449 aa  333  1e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 457 aa  330  8e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  48.46 
 
 		 456 aa  330  9e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  44.86 
 
 		 462 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  47.58 
 
 		 451 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  47.58 
 
 		 451 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  43.93 
 
 		 453 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 446 aa  327  9e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 460 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  46.56 
 
 		 461 aa  325  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  42.97 
 
 		 442 aa  325  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  44.47 
 
 		 451 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  46.11 
 
 		 452 aa  325  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  48.34 
 
 		 451 aa  325  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  46.37 
 
 		 452 aa  323  7e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  44.19 
 
 		 463 aa  323  7e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  44.9 
 
 		 451 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  46.43 
 
 		 508 aa  320  6e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  43.41 
 
 		 457 aa  320  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  45.48 
 
 		 469 aa  319  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0325  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 465 aa  319  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.405271  normal  0.564543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>