More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1608 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  84.08 
 
 		 507 aa  884    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  82.87 
 
 		 511 aa  851    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  100 
 
 		 511 aa  1039    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  77.15 
 
 		 516 aa  769    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  85.55 
 
 		 507 aa  891    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  81.64 
 
 		 510 aa  855    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  73.09 
 
 		 526 aa  752    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  46.28 
 
 		 509 aa  418  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  43.28 
 
 		 522 aa  415  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  43.89 
 
 		 529 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  44.81 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  41.68 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  44.37 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.21 
 
 		 456 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.5 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  45.88 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  47.3 
 
 		 454 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  46.4 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 446 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  45.74 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.39 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  42.83 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.32 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  45 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  49.12 
 
 		 945 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  41.55 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.09 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  46.37 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  42.98 
 
 		 514 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.27 
 
 		 441 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  44.69 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  43.95 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  43.4 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 459 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 528 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  47.31 
 
 		 456 aa  372  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  44.01 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.2 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  43.92 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.88 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 444 aa  362  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  43.23 
 
 		 508 aa  362  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 481 aa  362  9e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 440 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  46.38 
 
 		 451 aa  359  8e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 463 aa  356  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  43.31 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  43.53 
 
 		 465 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  42.18 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  43.53 
 
 		 465 aa  353  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  46.15 
 
 		 450 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 463 aa  353  5e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  41.67 
 
 		 462 aa  352  7e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  42.51 
 
 		 464 aa  352  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  43.3 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  41.12 
 
 		 460 aa  350  3e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  42.6 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  41.12 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  42.19 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0251  replicative DNA helicase  42.76 
 
 		 478 aa  350  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000686038  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  42.28 
 
 		 464 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  41.07 
 
 		 460 aa  349  7e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3941  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  43.96 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 447 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3765  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  42.19 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0755  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 468 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000903078  normal  0.0879158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  41.28 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  42.32 
 
 		 464 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3855  replicative DNA helicase  43.05 
 
 		 451 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000204415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  43.78 
 
 		 468 aa  346  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  43.41 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  43.58 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  43.41 
 
 		 468 aa  345  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  40.99 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>