More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0338 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  100 
 
 
516 aa  1048    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  76.27 
 
 
507 aa  793    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  75.35 
 
 
511 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  78.02 
 
 
511 aa  803    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  75.98 
 
 
507 aa  782    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  80.68 
 
 
526 aa  811    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  75.64 
 
 
510 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  46.28 
 
 
509 aa  410  1e-113  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  44.15 
 
 
513 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  43.14 
 
 
525 aa  405  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  44.58 
 
 
539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  45.53 
 
 
529 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  42.83 
 
 
522 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.06 
 
 
454 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  43.11 
 
 
512 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  45.96 
 
 
456 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  45.93 
 
 
454 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  44.84 
 
 
453 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
449 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  382  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  44.12 
 
 
453 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  44.3 
 
 
446 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  45.7 
 
 
524 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  45.17 
 
 
442 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.74 
 
 
453 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  44.17 
 
 
528 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  43.62 
 
 
514 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  45.7 
 
 
441 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  42.92 
 
 
459 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  45.48 
 
 
445 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  44.84 
 
 
456 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  44.96 
 
 
449 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
481 aa  368  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  43.62 
 
 
448 aa  368  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  43.85 
 
 
445 aa  366  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  47.1 
 
 
945 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  44.08 
 
 
449 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  43.78 
 
 
444 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.15 
 
 
456 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.79 
 
 
471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  43.86 
 
 
449 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
458 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.52 
 
 
481 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  44.14 
 
 
440 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  44.9 
 
 
444 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
456 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  43.64 
 
 
446 aa  355  8.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  42.63 
 
 
444 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  42.63 
 
 
439 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  43.99 
 
 
508 aa  350  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  42.12 
 
 
453 aa  349  6e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  42.23 
 
 
461 aa  345  8e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  43.07 
 
 
468 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  43.07 
 
 
468 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  45.1 
 
 
456 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  43.07 
 
 
468 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  43.07 
 
 
468 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  42.53 
 
 
442 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  43.07 
 
 
468 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  41.5 
 
 
460 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0517  replicative DNA helicase  44.27 
 
 
445 aa  343  4e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0466276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  41.5 
 
 
460 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  43.01 
 
 
468 aa  342  8e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  41.76 
 
 
476 aa  342  9e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  42.64 
 
 
468 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  42.64 
 
 
468 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  42.64 
 
 
468 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  42.95 
 
 
442 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  42.64 
 
 
468 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3346  replicative DNA helicase  42.42 
 
 
468 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0700986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  45 
 
 
451 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
463 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
465 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  41.47 
 
 
461 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  40.61 
 
 
465 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  43.12 
 
 
465 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  45.45 
 
 
450 aa  340  4e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  42.89 
 
 
465 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  41.99 
 
 
464 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  42.33 
 
 
460 aa  340  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0667  replicative DNA helicase  42.57 
 
 
446 aa  339  9e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  42.66 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  42.89 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  41.94 
 
 
465 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  42.76 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  43.31 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  43.31 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  40.26 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  42.55 
 
 
471 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>