More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2060 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  100 
 
 		 522 aa  1073    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  61.51 
 
 		 539 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1349  primary replicative DNA helicase  63.44 
 
 		 513 aa  611  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00606931  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  62.47 
 
 		 529 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  61.39 
 
 		 509 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7239  replicative DNA helicase  55.21 
 
 		 524 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.167922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  58 
 
 		 525 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00845  replicative DNA helicase  53.19 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.243087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0041  replicative DNA helicase  57.56 
 
 		 514 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1242  replicative DNA helicase  55.36 
 
 		 528 aa  507  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  49.89 
 
 		 445 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  47.57 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.54 
 
 		 442 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1608  DnaB helicase  43.28 
 
 		 511 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  46.55 
 
 		 453 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  45.9 
 
 		 449 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  46.55 
 
 		 448 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  46.76 
 
 		 440 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  49.17 
 
 		 945 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0342  replicative DNA helicase  42.28 
 
 		 510 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1913  DnaB helicase  42.69 
 
 		 511 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  44.1 
 
 		 449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  46.55 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.1 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  45.21 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  45.27 
 
 		 456 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.67 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.26 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0264  replicative DNA helicase  42.12 
 
 		 507 aa  403  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  45.01 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2606  replicative DNA helicase  44.42 
 
 		 507 aa  402  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  46.34 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  46.29 
 
 		 444 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.41 
 
 		 447 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  46.51 
 
 		 446 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.97 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  43.2 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  43.27 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0338  replicative DNA helicase  43.11 
 
 		 516 aa  388  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  44.04 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  44.67 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.59 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  44.3 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  46.44 
 
 		 450 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.37 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0364  replicative DNA helicase  42.35 
 
 		 526 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  42.79 
 
 		 456 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  45.25 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  44.52 
 
 		 442 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  46.1 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  47.1 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  41.01 
 
 		 457 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  44.07 
 
 		 444 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  44.07 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  45.21 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  45.21 
 
 		 460 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  45.21 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  41.96 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  41.39 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  43.74 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  42.23 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  40.72 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  43.58 
 
 		 471 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  45.54 
 
 		 468 aa  372  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  44.39 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  42.11 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  42.92 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  43.36 
 
 		 444 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  43.36 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  45.07 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  40.65 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  42.63 
 
 		 452 aa  368  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  40.98 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  43.15 
 
 		 449 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  43.62 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  42.7 
 
 		 444 aa  365  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  42.22 
 
 		 454 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  40.53 
 
 		 460 aa  363  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  42.98 
 
 		 451 aa  362  9e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  42.86 
 
 		 476 aa  362  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1031  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 451 aa  359  8e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1089  replicative DNA helicase  42.95 
 
 		 451 aa  359  8e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  44.03 
 
 		 463 aa  359  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  42.13 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  42.19 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  42.13 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  43.46 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  44.54 
 
 		 468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>