More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2587 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  56.46 
 
 		 1272 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  55.3 
 
 		 945 aa  931    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  100 
 
 		 879 aa  1787    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  41.01 
 
 		 903 aa  637    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  79.24 
 
 		 446 aa  626  1e-178  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  38.8 
 
 		 874 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  71.79 
 
 		 437 aa  547  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  36.01 
 
 		 844 aa  514  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 1381 aa  499  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  46.26 
 
 		 602 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  49.58 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  53.47 
 
 		 448 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  50.26 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  50 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  51.03 
 
 		 453 aa  386  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  49.49 
 
 		 449 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  50 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 453 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  49.61 
 
 		 453 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.7 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  47.7 
 
 		 449 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  48.72 
 
 		 449 aa  379  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  42.51 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  49.1 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.8 
 
 		 454 aa  365  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  49.36 
 
 		 440 aa  365  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  45.92 
 
 		 446 aa  364  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  50.64 
 
 		 465 aa  364  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.45 
 
 		 445 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  42.3 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  48.84 
 
 		 454 aa  363  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.96 
 
 		 442 aa  362  2e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  47.55 
 
 		 441 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  50.13 
 
 		 444 aa  359  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  48.33 
 
 		 442 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  46.25 
 
 		 458 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  48.26 
 
 		 462 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  46.68 
 
 		 456 aa  356  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  46.43 
 
 		 456 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  47.31 
 
 		 446 aa  350  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  47.69 
 
 		 459 aa  346  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  47.42 
 
 		 444 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  47.06 
 
 		 461 aa  342  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  41.75 
 
 		 585 aa  340  5.9999999999999996e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  45.05 
 
 		 466 aa  338  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  45.05 
 
 		 466 aa  338  2.9999999999999997e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  46.58 
 
 		 468 aa  336  1e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  42.78 
 
 		 444 aa  335  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  36.31 
 
 		 1118 aa  334  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  42.78 
 
 		 439 aa  334  5e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  44.53 
 
 		 466 aa  333  7.000000000000001e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0655  replicative DNA helicase  47.56 
 
 		 447 aa  332  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.329356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.49 
 
 		 447 aa  332  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 473 aa  332  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  45.78 
 
 		 461 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0013  replicative DNA helicase  46.23 
 
 		 457 aa  331  5.0000000000000004e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  47.31 
 
 		 450 aa  330  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  46.04 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  49.11 
 
 		 463 aa  328  3e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2060  replicative DNA helicase  44.76 
 
 		 522 aa  328  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0671541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2391  replicative DNA helicase  47.34 
 
 		 469 aa  328  3e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  46.08 
 
 		 469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  46.13 
 
 		 453 aa  327  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  45.36 
 
 		 444 aa  326  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  44.61 
 
 		 471 aa  324  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  44.96 
 
 		 481 aa  324  6e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1073  replicative DNA helicase  44.07 
 
 		 539 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00005629  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0191  replicative DNA helicase  43.08 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.848822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  47.47 
 
 		 473 aa  323  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  46.84 
 
 		 463 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0915  replicative DNA helicase  47.59 
 
 		 462 aa  322  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388027  normal  0.30922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  46.58 
 
 		 473 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1873  prophage LambdaSa2, replicative DNA helicase  43.85 
 
 		 443 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.25587  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2139  replicative DNA helicase  44.5 
 
 		 451 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.147021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1790  replicative DNA helicase  47.59 
 
 		 461 aa  321  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0711961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1916  replicative DNA helicase  43.44 
 
 		 529 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27870  primary replicative DNA helicase  42.89 
 
 		 464 aa  320  6e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0308941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 463 aa  320  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  46.11 
 
 		 460 aa  320  6e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0026  replicative DNA helicase  43.73 
 
 		 470 aa  320  7e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.44109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  42.71 
 
 		 442 aa  320  7.999999999999999e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1779  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  320  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2452  replicative DNA helicase  47.59 
 
 		 461 aa  320  9e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.034153  normal  0.221442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1807  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  320  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  45.06 
 
 		 472 aa  319  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  43.69 
 
 		 481 aa  319  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  44.58 
 
 		 463 aa  319  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  320  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  320  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2286  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  319  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0006  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.176764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2183  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  319  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2247  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  319  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234397  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1163  replicative DNA helicase  47.09 
 
 		 460 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>