More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2895 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2895  DnaB domain protein helicase domain protein  100 
 
 		 448 aa  905    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213935  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0332  replicative DNA helicase  49.11 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2519  replicative DNA helicase  47.86 
 
 		 457 aa  385  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.662901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4552  replicative DNA helicase  48.87 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.355354  normal  0.656762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2083  primary replicative DNA helicase  49.21 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37750  primary replicative DNA helicase  46.83 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  46.31 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3350  replicative DNA helicase  45.84 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  46.62 
 
 		 457 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  45.66 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03060  primary replicative DNA helicase  45.43 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.602347  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02520  primary replicative DNA helicase  46.17 
 
 		 455 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  45.5 
 
 		 454 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  44.34 
 
 		 460 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 461 aa  360  4e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  44.85 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0137  replicative DNA helicase  47.97 
 
 		 474 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174045  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4164  replicative DNA helicase  44.49 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7308  replicative DNA helicase  44.87 
 
 		 452 aa  348  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036629  normal  0.0750337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39470  primary replicative DNA helicase  43.65 
 
 		 459 aa  345  8.999999999999999e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0340273  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5742  replicative DNA helicase  44.72 
 
 		 460 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4518  primary replicative DNA helicase  44.44 
 
 		 452 aa  343  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5558  replicative DNA helicase  44.22 
 
 		 464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148847 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5469  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 448 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.430835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5868  replicative DNA helicase  43.54 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0075  replicative DNA helicase  41.69 
 
 		 481 aa  315  8e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000995062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  46.31 
 
 		 844 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1232  replicative DNA helicase  41.31 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  45.22 
 
 		 903 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  38.44 
 
 		 448 aa  290  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  42.46 
 
 		 874 aa  282  9e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6265  replicative DNA helicase  38.81 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  35.16 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  35.29 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  36.3 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  36.01 
 
 		 449 aa  269  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  36.3 
 
 		 459 aa  268  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  37.13 
 
 		 440 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  36.47 
 
 		 476 aa  266  7e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  34.54 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  34.76 
 
 		 460 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  34.69 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  36.24 
 
 		 476 aa  263  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  35.54 
 
 		 458 aa  262  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  36.53 
 
 		 444 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1003  replicative DNA helicase  35.28 
 
 		 473 aa  261  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.792284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  35.96 
 
 		 462 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  36.05 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  34.54 
 
 		 446 aa  259  9e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  36.55 
 
 		 442 aa  259  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0758  replicative DNA helicase  34.32 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000129174  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0713  primary replicative DNA helicase  34 
 
 		 468 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000291308  hitchhiker  0.0000817807 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  35.71 
 
 		 471 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  35.71 
 
 		 471 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3917  replicative DNA helicase  34.09 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3248  primary replicative DNA helicase  34.09 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559812  hitchhiker  0.000199485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0692  primary replicative DNA helicase  34.09 
 
 		 468 aa  256  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000012144  hitchhiker  0.000391995 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  34.3 
 
 		 465 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  32.81 
 
 		 449 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  34.92 
 
 		 453 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  35.08 
 
 		 442 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  34.29 
 
 		 460 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0521  replicative DNA helicase  34 
 
 		 468 aa  249  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000437695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  34.32 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  34.47 
 
 		 461 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  35.93 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  33.41 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2782  replicative DNA helicase  34.14 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0192  replicative DNA helicase DnaB  33.64 
 
 		 466 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  35.67 
 
 		 481 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  33.71 
 
 		 470 aa  246  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  33.78 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  32.74 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3278  replicative DNA helicase  32.95 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000542812  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4361  replicative DNA helicase  33.26 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  36.64 
 
 		 453 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4449  replicative DNA helicase  32.81 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  33.85 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  34.37 
 
 		 463 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  34.3 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0716  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000107977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0737  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000169496  unclonable  0.00000000000388708 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0746  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000104004  hitchhiker  0.000200026 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3638  replicative DNA helicase  33.11 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  33.86 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  36.18 
 
 		 446 aa  243  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1975  replicative DNA helicase  35.56 
 
 		 453 aa  243  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  33.41 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  34.76 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0709  replicative DNA helicase  32.36 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.446407  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3581  replicative DNA helicase  32.73 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000011661  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0948  hypothetical protein  33.85 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>