More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1462 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  100 
 
 
2605 aa  5290    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  63.29 
 
 
602 aa  514  1e-144  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  42.45 
 
 
1272 aa  480  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  46.68 
 
 
1098 aa  420  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3529  replicative DNA helicase  48.15 
 
 
593 aa  362  4e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0449592  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1083  replicative DNA helicase  43.37 
 
 
610 aa  335  8e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.247036  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0931  replicative DNA helicase  43.13 
 
 
610 aa  331  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0041  replicative DNA helicase  42.72 
 
 
585 aa  318  9.999999999999999e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  68.87 
 
 
450 aa  306  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  46.75 
 
 
1381 aa  294  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  53.76 
 
 
879 aa  290  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  63.16 
 
 
444 aa  276  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  63.16 
 
 
444 aa  276  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  48.92 
 
 
945 aa  270  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  54.46 
 
 
472 aa  260  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  54.46 
 
 
472 aa  260  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  53.99 
 
 
471 aa  260  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  57.21 
 
 
454 aa  259  4e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  55.27 
 
 
450 aa  259  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  56.94 
 
 
460 aa  257  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  56.4 
 
 
468 aa  255  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  54.98 
 
 
471 aa  253  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  55.19 
 
 
460 aa  254  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  55.02 
 
 
460 aa  252  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  55.02 
 
 
460 aa  252  8e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  54.5 
 
 
472 aa  249  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  53.12 
 
 
849 aa  247  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0029  DnaB helicase  49.17 
 
 
449 aa  226  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  38.87 
 
 
1118 aa  225  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  38.05 
 
 
903 aa  223  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  40.14 
 
 
874 aa  210  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0328  DnaB-like helicase  45.64 
 
 
449 aa  207  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0149353  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  40 
 
 
844 aa  204  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5618  replicative DNA helicase  44.13 
 
 
318 aa  198  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000715712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.95 
 
 
446 aa  194  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  53.59 
 
 
456 aa  194  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  53.71 
 
 
444 aa  193  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.23 
 
 
449 aa  193  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  51.96 
 
 
442 aa  192  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  51.93 
 
 
456 aa  191  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  46.81 
 
 
449 aa  191  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  53.63 
 
 
440 aa  190  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  48.65 
 
 
461 aa  190  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  43.48 
 
 
453 aa  189  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  44.53 
 
 
459 aa  189  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  43.08 
 
 
453 aa  189  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  52.25 
 
 
446 aa  189  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  51.83 
 
 
446 aa  189  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  43.08 
 
 
449 aa  189  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  45.58 
 
 
821 aa  188  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  52.63 
 
 
441 aa  188  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  51.37 
 
 
448 aa  187  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  51.55 
 
 
442 aa  187  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  52.69 
 
 
461 aa  187  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  45.54 
 
 
831 aa  186  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  50 
 
 
447 aa  186  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0012  primary replicative DNA helicase  49.73 
 
 
463 aa  186  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.781358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  47.11 
 
 
449 aa  186  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  44.08 
 
 
453 aa  186  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  49.2 
 
 
456 aa  185  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  52.81 
 
 
453 aa  185  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  50 
 
 
444 aa  185  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  51.05 
 
 
465 aa  184  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  50.84 
 
 
460 aa  184  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0216  replicative DNA helicase  51.91 
 
 
447 aa  182  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  52.49 
 
 
473 aa  182  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  51.67 
 
 
468 aa  182  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  53.8 
 
 
476 aa  181  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  46.28 
 
 
463 aa  181  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  53.14 
 
 
444 aa  181  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  52.81 
 
 
454 aa  181  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  52.81 
 
 
454 aa  180  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0985  replicative DNA helicase  51.93 
 
 
472 aa  180  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  47.75 
 
 
444 aa  180  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  52.05 
 
 
471 aa  179  5e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  52.05 
 
 
471 aa  179  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  46.43 
 
 
460 aa  179  6e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  42.72 
 
 
807 aa  179  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  47.62 
 
 
445 aa  179  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  46.43 
 
 
460 aa  179  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  53.22 
 
 
476 aa  178  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3596  replicative DNA helicase  50 
 
 
437 aa  177  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  52.63 
 
 
472 aa  177  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  39.67 
 
 
782 aa  177  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  39.67 
 
 
782 aa  177  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  46.81 
 
 
457 aa  177  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  46.81 
 
 
457 aa  177  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  48.94 
 
 
469 aa  176  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  49.72 
 
 
469 aa  176  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  45.56 
 
 
472 aa  176  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  53.59 
 
 
472 aa  176  5e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  53.59 
 
 
472 aa  176  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  50.59 
 
 
450 aa  176  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  46.35 
 
 
462 aa  174  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>