More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1337 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4119  replicative DNA helicase  71.46 
 
 
444 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4159  replicative DNA helicase  71.69 
 
 
444 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.275363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1337  replicative DNA helicase  100 
 
 
450 aa  914    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  66.82 
 
 
450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  61.33 
 
 
454 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1766  DnaB replicative helicase  59.95 
 
 
460 aa  545  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18641  DnaB replicative helicase  59.72 
 
 
460 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.753101  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18641  DnaB replicative helicase  59.95 
 
 
460 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18831  DnaB replicative helicase  59.49 
 
 
460 aa  541  1e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0823462  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  60.05 
 
 
468 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1273  DnaB replicative helicase  59.26 
 
 
472 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  59.12 
 
 
472 aa  532  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  59.26 
 
 
472 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2194  DnaB helicase  58.66 
 
 
471 aa  531  1e-149  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18011  DnaB replicative helicase  58.8 
 
 
471 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.810301  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  63.78 
 
 
602 aa  501  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0029  DnaB helicase  52.51 
 
 
449 aa  458  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  48.86 
 
 
445 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  48.06 
 
 
446 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  48.42 
 
 
453 aa  420  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  47.96 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  47.96 
 
 
449 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  47.74 
 
 
453 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  50 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  48.51 
 
 
454 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  48.05 
 
 
448 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  48.05 
 
 
454 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  48.28 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  47.83 
 
 
449 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  48.85 
 
 
440 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  46.09 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  47.93 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  46.09 
 
 
456 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  46.92 
 
 
449 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  46.08 
 
 
445 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3990  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
444 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  45.08 
 
 
442 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  46.1 
 
 
447 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  45.66 
 
 
459 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2003  replicative DNA helicase  46.88 
 
 
450 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1220  primary replicative DNA helicase  47.82 
 
 
469 aa  381  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  44.04 
 
 
441 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  45.85 
 
 
444 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  47.15 
 
 
453 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  46.09 
 
 
462 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1149  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
444 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000486046  hitchhiker  0.00581399 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.21 
 
 
444 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.21 
 
 
439 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1815  replicative DNA helicase  45.54 
 
 
446 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
461 aa  375  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  45.56 
 
 
456 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  44.04 
 
 
442 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  44.59 
 
 
476 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  45.35 
 
 
476 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
471 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  44.55 
 
 
471 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  44.47 
 
 
463 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  44.5 
 
 
481 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  45.89 
 
 
460 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  45.98 
 
 
458 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  45.64 
 
 
465 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  45.09 
 
 
461 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  45.03 
 
 
470 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0649  replicative DNA helicase  43.5 
 
 
464 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  43.44 
 
 
446 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  44.71 
 
 
462 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  43.86 
 
 
472 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  44.71 
 
 
462 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  43.69 
 
 
456 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  44.4 
 
 
473 aa  362  8e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4930  replicative DNA helicase  43.57 
 
 
465 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000680092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5658  replicative DNA helicase  43.71 
 
 
464 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65130  replicative DNA helicase  43.71 
 
 
464 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4754  replicative DNA helicase  43.57 
 
 
465 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.100967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  44.29 
 
 
470 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4873  replicative DNA helicase  43.34 
 
 
465 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.495294  normal  0.581353 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0016  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
466 aa  360  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0016  replicative DNA helicase  43.56 
 
 
466 aa  360  4e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4664  replicative DNA helicase  43.12 
 
 
465 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0851035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3461  replicative DNA helicase  43.34 
 
 
458 aa  359  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.951861  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2537  replicative DNA helicase  43.11 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  44.05 
 
 
463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07680  replicative DNA helicase  42.38 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4929  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2442  replicative DNA helicase  43.12 
 
 
457 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2819  replicative DNA helicase  43.12 
 
 
457 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  43.15 
 
 
473 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2580  replicative DNA helicase  43.46 
 
 
468 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.962288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  42.92 
 
 
481 aa  353  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  45.31 
 
 
450 aa  353  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  42.95 
 
 
456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  42.6 
 
 
465 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0585  replicative DNA helicase  42.15 
 
 
464 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.35566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  42.44 
 
 
443 aa  352  8.999999999999999e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>